Chapitre 9 • Profils physico-chimiques
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Ces profils sont utilisés pour pouvoir obtenir des anticorps contre des protéines
entières à partir de peptides hydrophiles et accessibles au solvant sélectionnées au
moyen de profils physico-chimiques, synthétisés par voie chimique et finalement
injectés à des animaux. Cette stratégie ne nécessite pas de purifier la protéine pour
obtenir des anticorps susceptibles de reconnaître la protéine entière. Enfin, il faut
souligner que de nombreux autres profils existent (profil de flexibilité, de régions
transmembranaires, d’identifications de peptides signaux, de localisation dans les
différents compartiments sub-cellulaires).
Figure 9.5 – Profils d’accessibilité au solvant.
20 40 60 80 100 120 140 160 180 200 220 240 260 280 300 320 340 360 380 400 420 440 460 480 500 520 540 560 580 600 620 640 660 680 700 720 740 760 780 800
Hydrophobicity
Hydrophilicity
Antigenicity
by Parker et al
Antigenicity
by Welling et al
Helical
membranous
regions
Solvent
Accessibility
ANTHEPROT 6.2.62 by G. Deléage g.deleage@ibcp.fr Copyright IBCP-CNRS (1999) 7, passage du Vercors, 69367 cedex Lyon - FRANCE
Profiles of physico-chemical properties of C:\Asus\Antheprot\F_Bleicher\C115.SEQ
N° 195
AA : LKDRQG
0
5
K D K
QT
-2,85
0,663
1,21
-0,57
3,85
Figure 9.6 – Régions utilisées (6 acides aminés de part et d’autre du
curseur) avec succès dans une stratégie d’obtention d’anticorps.
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Ces profils sont utilisés pour pouvoir obtenir des anticorps contre des protéines
entières à partir de peptides hydrophiles et accessibles au solvant sélectionnées au
moyen de profils physico-chimiques, synthétisés par voie chimique et finalement
injectés à des animaux. Cette stratégie ne nécessite pas de purifier la protéine pour
obtenir des anticorps susceptibles de reconnaître la protéine entière. Enfin, il faut
souligner que de nombreux autres profils existent (profil de flexibilité, de régions
transmembranaires, d’identifications de peptides signaux, de localisation dans les
différents compartiments sub-cellulaires).
Figure 9.5 – Profils d’accessibilité au solvant.
20 40 60 80 100 120 140 160 180 200 220 240 260 280 300 320 340 360 380 400 420 440 460 480 500 520 540 560 580 600 620 640 660 680 700 720 740 760 780 800
Hydrophobicity
Hydrophilicity
Antigenicity
by Parker et al
Antigenicity
by Welling et al
Helical
membranous
regions
Solvent
Accessibility
ANTHEPROT 6.2.62 by G. Deléage g.deleage@ibcp.fr Copyright IBCP-CNRS (1999) 7, passage du Vercors, 69367 cedex Lyon - FRANCE
Profiles of physico-chemical properties of C:\Asus\Antheprot\F_Bleicher\C115.SEQ
N° 195
AA : LKDRQG
0
5
K D K
QT
-2,85
0,663
1,21
-0,57
3,85
Figure 9.6 – Régions utilisées (6 acides aminés de part et d’autre du
curseur) avec succès dans une stratégie d’obtention d’anticorps.