Chapitre II.
Matériel et méthodes d’étude
21
3.2. Superposition des formes
Une fois les fichiers de digitalisation sont prêts, l’analyse procrustéenne générale (GPA) aura
lieu à l’aide du logiciel R. Cette analyse nous permettra de minimiser la variation autour des
centres de gravité des objets, l’effet de la taille sera ensuite éliminé par normalisation de la
matrice et à la fin une rotation des objets pour les superposé.
Les coordonnées prises par digitalisation subissent 10 itérations de normalisation par la méthode
des moindres carrés pour minimiser les distances entre les points repères homologues des
différents opercules étudiés.
Pour éliminer l’effet d’allométrie, les coordonnées procrustéennes des différents points repères
dans le plan tangentiel seront modéliser par une régression multiple au centroïdes et les résiduels
seront utilisé dans la poursuite d’analyse afin de minimiser la variation intragroupe et de se
concentrer sur l’analyse des variations entre groupes.
Figure II. 4. Etapes d’analyse de la morphométrie géométrique
Matériel et méthodes d’étude
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3.2. Superposition des formes
Une fois les fichiers de digitalisation sont prêts, l’analyse procrustéenne générale (GPA) aura
lieu à l’aide du logiciel R. Cette analyse nous permettra de minimiser la variation autour des
centres de gravité des objets, l’effet de la taille sera ensuite éliminé par normalisation de la
matrice et à la fin une rotation des objets pour les superposé.
Les coordonnées prises par digitalisation subissent 10 itérations de normalisation par la méthode
des moindres carrés pour minimiser les distances entre les points repères homologues des
différents opercules étudiés.
Pour éliminer l’effet d’allométrie, les coordonnées procrustéennes des différents points repères
dans le plan tangentiel seront modéliser par une régression multiple au centroïdes et les résiduels
seront utilisé dans la poursuite d’analyse afin de minimiser la variation intragroupe et de se
concentrer sur l’analyse des variations entre groupes.
Figure II. 4. Etapes d’analyse de la morphométrie géométrique
