CONCLUSIONS
ET
PERSPECTIVES
153
Dans cette perspective, nous avons abordé différents axes de recherche :
• L’élaboration d’une collection de souches aptes à se développer en présence
d’hydrocarbures.
• Calculer les indices de diversités des échantillons d’eau et de sédiments on utilisant
une méthode indépendante à la culture.
• La caractérisation moléculaire des bactéries isolées afin d’avoir des connaissances sur
les communautés microbiennes associées aux hydrocarbures pétroliers.
• Le suivi de la biodégradation par chromatographie (GC-FID) afin de mesurer la
capacité de dégradation des bactéries sélectionnées en réponse à l’effet polluant ou
stimulant de l’hydrocarbure.
• L’étude et détection de gènes fonctionnels chez les bactéries sélectionnées afin de
mettre en évidence des mécanismes adaptatifs mis en place par certaines bactéries en
réponse à la contamination.
• L’étude du pouvoir de productions de biosurfactants par les souches isolées.
Cette étude a été menée sur les communautés bactériennes présentes dans l’eau de mer et
sédiment du port de Sidi Fredj (Alger). Ce port est soumis à une pollution chronique par les
hydrocarbures et constitue donc un milieu propice à la croissance des bactéries
hydrocarbonoclastes. En effet, ces populations bactériennes sont supposées posséder les
systèmes enzymatiques permettant de répondre à la contamination.
Dans cette étude, nous avons fait appel à l’utilisation de techniques de biologie moléculaire
afin d’accéder à l’identification précise des microorganismes (extraction d’ADN, PCR,
séquençage, analyse par bioinformatique et dépôt de séquences dans la banque de données
universelle « GenBank ») couplées à des méthodes analytiques chimiques (GC-FID)
permettant le dosage résiduel des hydrocarbures.
Plusieurs points de conclusion peuvent être tirés de ce travail :
• Etude de la diversité microbienne:
L’étude de la diversité bactérienne a été réalisée par deux méthodes : La DGGE qui est une
méthode indépendante à la culture a révélé une diversité plus importante dans les échantillons
d’eau par rapport à ceux du sédiment. Le calcul des indices de biodiversité a révélé une bonne
diversité entre les différentes stations, et ce malgré l’étroitesse entre les différents points de
prélèvements.
ET
PERSPECTIVES
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Dans cette perspective, nous avons abordé différents axes de recherche :
• L’élaboration d’une collection de souches aptes à se développer en présence
d’hydrocarbures.
• Calculer les indices de diversités des échantillons d’eau et de sédiments on utilisant
une méthode indépendante à la culture.
• La caractérisation moléculaire des bactéries isolées afin d’avoir des connaissances sur
les communautés microbiennes associées aux hydrocarbures pétroliers.
• Le suivi de la biodégradation par chromatographie (GC-FID) afin de mesurer la
capacité de dégradation des bactéries sélectionnées en réponse à l’effet polluant ou
stimulant de l’hydrocarbure.
• L’étude et détection de gènes fonctionnels chez les bactéries sélectionnées afin de
mettre en évidence des mécanismes adaptatifs mis en place par certaines bactéries en
réponse à la contamination.
• L’étude du pouvoir de productions de biosurfactants par les souches isolées.
Cette étude a été menée sur les communautés bactériennes présentes dans l’eau de mer et
sédiment du port de Sidi Fredj (Alger). Ce port est soumis à une pollution chronique par les
hydrocarbures et constitue donc un milieu propice à la croissance des bactéries
hydrocarbonoclastes. En effet, ces populations bactériennes sont supposées posséder les
systèmes enzymatiques permettant de répondre à la contamination.
Dans cette étude, nous avons fait appel à l’utilisation de techniques de biologie moléculaire
afin d’accéder à l’identification précise des microorganismes (extraction d’ADN, PCR,
séquençage, analyse par bioinformatique et dépôt de séquences dans la banque de données
universelle « GenBank ») couplées à des méthodes analytiques chimiques (GC-FID)
permettant le dosage résiduel des hydrocarbures.
Plusieurs points de conclusion peuvent être tirés de ce travail :
• Etude de la diversité microbienne:
L’étude de la diversité bactérienne a été réalisée par deux méthodes : La DGGE qui est une
méthode indépendante à la culture a révélé une diversité plus importante dans les échantillons
d’eau par rapport à ceux du sédiment. Le calcul des indices de biodiversité a révélé une bonne
diversité entre les différentes stations, et ce malgré l’étroitesse entre les différents points de
prélèvements.