CHAPITRE V
Résultats & Discussion
133
Contrairement aux souches précédentes, chez Gordonia, on a pu observer une phase de
latence. La bactérie a pris du temps pour synthétiser les enzymes adaptées au substrat (pétrole
brut). Le maximum de croissance est atteint au bout du 8
éme
jour d’incubation.
La croissance bactérienne pour les souches affiliées à Labrenzia, Pseudomonas, Halomonas,
Micrococcus et Xanthomarina a été linéaire du premier au huitième jour d’incubation puis
une phase stationnaire a été observée jusqu’au dernier jour d’incubation. Cependant les
densités optiques mesurées ont été inférieures à celle observées pour les souches précédentes.
V.11 Détection des gènes de dégradation.
V.11.1 Le gène alkB.
La capacité catabolique des bactéries à utiliser les hydrocarbures comme seule source de
carbone et d’énergie, dépend de la présence dans leur génome de gènes codants pour les
enzymes qui interviennent dans la voie de dégradation des polluants. L'une des enzymes clés
intervenant dans la première étape de la dégradation des alcanes est la monooxygénase alkB.
Cette enzyme, qui introduit des atomes d'oxygène dérivés de l'oxygène moléculaire dans le
substrat d'alcane, joue un rôle important dans la biodégradation du pétrole brut. À ce jour, des
alkB ont été trouvés dans divers environnements, tels que les sédiments d’Alaska, sol
contaminé, écosystèmes froids, site contaminé, un sol en vrac, sol arctique et antarctique et
eau de la mer des Sargasses (Van Beilen et al., 2003). Le gène alkB pourrait être utilisé
comme marqueur pour prédire le potentiel de dégradation du pétrole des différents
environnements (Van Beilen et al., 2003).
Afin vérifier la présence du gène alkB dans les isolats sélectionnées. Un fragment de 550 pb a
été amplifié à l'aide d'une paire d'amorces dégénérées (Kloos et al., 2006). La figure 49
présente les résultats d’amplification obtenus pour les bactéries sélectionnées.
Résultats & Discussion
133
Contrairement aux souches précédentes, chez Gordonia, on a pu observer une phase de
latence. La bactérie a pris du temps pour synthétiser les enzymes adaptées au substrat (pétrole
brut). Le maximum de croissance est atteint au bout du 8
éme
jour d’incubation.
La croissance bactérienne pour les souches affiliées à Labrenzia, Pseudomonas, Halomonas,
Micrococcus et Xanthomarina a été linéaire du premier au huitième jour d’incubation puis
une phase stationnaire a été observée jusqu’au dernier jour d’incubation. Cependant les
densités optiques mesurées ont été inférieures à celle observées pour les souches précédentes.
V.11 Détection des gènes de dégradation.
V.11.1 Le gène alkB.
La capacité catabolique des bactéries à utiliser les hydrocarbures comme seule source de
carbone et d’énergie, dépend de la présence dans leur génome de gènes codants pour les
enzymes qui interviennent dans la voie de dégradation des polluants. L'une des enzymes clés
intervenant dans la première étape de la dégradation des alcanes est la monooxygénase alkB.
Cette enzyme, qui introduit des atomes d'oxygène dérivés de l'oxygène moléculaire dans le
substrat d'alcane, joue un rôle important dans la biodégradation du pétrole brut. À ce jour, des
alkB ont été trouvés dans divers environnements, tels que les sédiments d’Alaska, sol
contaminé, écosystèmes froids, site contaminé, un sol en vrac, sol arctique et antarctique et
eau de la mer des Sargasses (Van Beilen et al., 2003). Le gène alkB pourrait être utilisé
comme marqueur pour prédire le potentiel de dégradation du pétrole des différents
environnements (Van Beilen et al., 2003).
Afin vérifier la présence du gène alkB dans les isolats sélectionnées. Un fragment de 550 pb a
été amplifié à l'aide d'une paire d'amorces dégénérées (Kloos et al., 2006). La figure 49
présente les résultats d’amplification obtenus pour les bactéries sélectionnées.