CHAPITRE V
Résultats & Discussion
122
Figure 45. Gel d’électrophorèse des produits PCR d’ADNr16S des souches sélectionnées (C=Contrôle négatif, M= marqueur de taille 1k bp)
Dans la présente étude, la recherche de micro-organismes susceptibles d’utiliser des
hydrocarbures pétroliers reposait sur leur capacité à se développer dans un milieu minéral
contenant des hydrocarbures comme seule source de carbone et d’énergie. L’alignement des
séquences dans les bases de données NCBI Genbank et RDP (Ribosomal Database Project) a
montré une affiliation des souches sélectionnées à trois phyla bactériens: Proteobacteria (19
isolats), Actinobacteria (3 isolats) et Bacteroidetes (un isolat). Les protéobactéries
représentaient près de 83% des souches isolées, suivies d’Actinobacteria (13%) et des
Bacteroidetes (4%).
Les souches identifiées appartiennent à différents genres précédemment rapportés comme
dégradant les hydrocarbures. Le groupe des protéobactéries se rencontre couramment dans les
communautés microbiennes exposées à la pollution par les hydrocarbures (McKew et al.,
2007).
Résultats & Discussion
122
Figure 45. Gel d’électrophorèse des produits PCR d’ADNr16S des souches sélectionnées (C=Contrôle négatif, M= marqueur de taille 1k bp)
Dans la présente étude, la recherche de micro-organismes susceptibles d’utiliser des
hydrocarbures pétroliers reposait sur leur capacité à se développer dans un milieu minéral
contenant des hydrocarbures comme seule source de carbone et d’énergie. L’alignement des
séquences dans les bases de données NCBI Genbank et RDP (Ribosomal Database Project) a
montré une affiliation des souches sélectionnées à trois phyla bactériens: Proteobacteria (19
isolats), Actinobacteria (3 isolats) et Bacteroidetes (un isolat). Les protéobactéries
représentaient près de 83% des souches isolées, suivies d’Actinobacteria (13%) et des
Bacteroidetes (4%).
Les souches identifiées appartiennent à différents genres précédemment rapportés comme
dégradant les hydrocarbures. Le groupe des protéobactéries se rencontre couramment dans les
communautés microbiennes exposées à la pollution par les hydrocarbures (McKew et al.,
2007).
