CHAPITRE V
Résultats & Discussion
121
Selon les résultats obtenus, les souches sélectionnées sont circulaires, de tailles petites à
moyennes (diamètre entre 0,5 et 2 mm), toutes les souches sont en forme de bâtonnets (à
l’exception de la souche PSF-23S), à contour régulier, des colonies blanches, crèmes, jaunes,
roses et rouge à croissance relativement lente.
Cette étude a montré la prédominance des bactéries Gram négatif ce qui est en accord avec les
résultats décrits dans la littérature (Juhasz et Naidu, 2000 ; Hagström et al., 2002; Roling et
al., 2002 ; Chouari, 2003; Margesin et al., 2003; Gargouri et al., 2012; M’Rassi, 2014).
Selon Pelmont (1995) les bactéries aptes à biodégrader les hydrocarbures
sont
majoritairement des bacilles Gram négatif. Ces bactéries sont moins sensibles aux composés
toxiques que les bactéries à Gram positif (Stancu et grifoll, 2011).
Selon Soltani (2004), des changements dans les paramètres de l’environnement (température,
salinité, pH, source de carbone, …) sont accompagnés par des modifications dans la
composition membranaire, et en particulier les acides gras membranaires dans le but de
protéger la bactérie. La complexité de la paroi cellulaire bactérienne à Gram négatif, pourrait
entraver la pénétration de certaines substances et de leur entrée dans le cytoplasme.
Seulement trois bactéries à Gram positif ont été isolées. Même si le rôle des bactéries à Gram
positif dans la biodégradation des hydrocarbures est moins connu, ces organismes se sont
révélés des candidats potentiels pour des applications biotechnologiques (Das et Chandran,
2011). Les bactéries Gram+, et plus particulièrement celles appartenant au phylum des
Actinobactéries, sont aussi impliquées dans la dégradation des hydrocarbures.
V.7 Caractérisation moléculaire des souches sélectionnées.
L’ADN a été directement extrait des souches puis l’ADN 16S a été amplifié par PCR grâce
aux amorces universelles du domaine Bacteria. Des fragments d'environ 1500 pb ont été
obtenus (figure 45).
Les produits PCR ont ensuite été purifiés et séquencés. Les séquences ont été comparées avec
les séquences de la banque de données dans Genbank-BLASTn. Les résultats sont présentés
dans le tableau 22. Les séquences déterminées dans cette étude, sont déposées à GenBank
database du National Center for Biotechnology Information (NCBI) et désignées sous les
numéros d’Accession de MH425630 à MH425652.
Résultats & Discussion
121
Selon les résultats obtenus, les souches sélectionnées sont circulaires, de tailles petites à
moyennes (diamètre entre 0,5 et 2 mm), toutes les souches sont en forme de bâtonnets (à
l’exception de la souche PSF-23S), à contour régulier, des colonies blanches, crèmes, jaunes,
roses et rouge à croissance relativement lente.
Cette étude a montré la prédominance des bactéries Gram négatif ce qui est en accord avec les
résultats décrits dans la littérature (Juhasz et Naidu, 2000 ; Hagström et al., 2002; Roling et
al., 2002 ; Chouari, 2003; Margesin et al., 2003; Gargouri et al., 2012; M’Rassi, 2014).
Selon Pelmont (1995) les bactéries aptes à biodégrader les hydrocarbures
sont
majoritairement des bacilles Gram négatif. Ces bactéries sont moins sensibles aux composés
toxiques que les bactéries à Gram positif (Stancu et grifoll, 2011).
Selon Soltani (2004), des changements dans les paramètres de l’environnement (température,
salinité, pH, source de carbone, …) sont accompagnés par des modifications dans la
composition membranaire, et en particulier les acides gras membranaires dans le but de
protéger la bactérie. La complexité de la paroi cellulaire bactérienne à Gram négatif, pourrait
entraver la pénétration de certaines substances et de leur entrée dans le cytoplasme.
Seulement trois bactéries à Gram positif ont été isolées. Même si le rôle des bactéries à Gram
positif dans la biodégradation des hydrocarbures est moins connu, ces organismes se sont
révélés des candidats potentiels pour des applications biotechnologiques (Das et Chandran,
2011). Les bactéries Gram+, et plus particulièrement celles appartenant au phylum des
Actinobactéries, sont aussi impliquées dans la dégradation des hydrocarbures.
V.7 Caractérisation moléculaire des souches sélectionnées.
L’ADN a été directement extrait des souches puis l’ADN 16S a été amplifié par PCR grâce
aux amorces universelles du domaine Bacteria. Des fragments d'environ 1500 pb ont été
obtenus (figure 45).
Les produits PCR ont ensuite été purifiés et séquencés. Les séquences ont été comparées avec
les séquences de la banque de données dans Genbank-BLASTn. Les résultats sont présentés
dans le tableau 22. Les séquences déterminées dans cette étude, sont déposées à GenBank
database du National Center for Biotechnology Information (NCBI) et désignées sous les
numéros d’Accession de MH425630 à MH425652.