CHAPITRE V
Résultats & Discussion

 

 
 
 
 
 

 
116
 
Sept à trente et une bandes discernables ont été observées avec des intensités variables.
Certaines bandes étaient spécifiques à un site donné, alors que d'autres étaient communes à
plus d’un échantillon (figure 44, B). L'analyse visuelle des profils DGGE a révélé une
similarité de la migration entre les différents échantillons.
Cependant l’analyse des profils DGGE par l’outil PAST a révélé que la composition de la
communauté bactérienne de l'eau de mer et les sédiments étaient partiellement distincts, bien
que quelques bandes identiques ont été identifiés dans tous les profils d’eau de mer et de
sédiments. Les indices de diversité calculés pour chaque profil DGGE étaient en général plus
élevés et plus variables dans les échantillons d’eau de mer que dans les échantillons de
sédiment.
Tableau 19. Indices de diversité (PAST software) basés sur les profiles DGGE des
populations bactériennes présentes dans les échantillons d’eau et de sédiment du port de Sidi
Fredj.
Sédiment
Eau de mer
Sed1
Sed2
Sed3
Sed4
Sw1
Sw2
Sw3
Sw4
N
Bandes
20
11
12
7
27
30
31
19
Shannon 3,00
2,40
2,48
1,95
3,30
3,40
3,43
2,94
Chao-1
210
66
78
28
378
465
496
190
Indice de Shannon H= -
𝑃𝑖 ln 𝑃𝑖
!
!
avec Pi= proportion de la bande i soit 1/N avec N=nombre de bandes
Chao-1 = N +
!  (!!!)
!
avec N= nombre de bandes
Plus le nombre de bandes différentes sur l’électrophorètogramme est grand, plus la
biodiversité est importante. L’échantillon d’eau de la station S3 présentait l’indice Chao de
diversité le plus élevé (496), tandis que le sédiment provenant de la station S4, le plus bas
(28) (tableau 19). L’indice moyen de Chao dans l’eau de mer était de 382.