CHAPITRE V
Résultats & Discussion

 

 
 
 
 
 

 
114
 
V.3 Mesure de l’abondance bactérienne.

 
L’abondance microbienne totale mesurée par comptage DAPI à partir des échantillons d’eau
de mer du port de Sidi Fredj a montré que le nombre de cellules totales variait entre 4,62 ×
10
4
et 4,14 × 10
5
cellules par ml. Les valeurs obtenues dans les stations 3, 4 et 5 sont
semblables au nombre de cellule dans l’eau de mer de surface estimé à >10
5
cellules par ml
(Porter et Feig, 1980; Hobbie et al., 1977 ; Kumar et al., 2019). Cependant le nombre de
cellules obtenu dans les stations 1 et 2 est faible (<10
5
) (figure 42).
Des valeurs comprises entre 10
5
et 10
7
cellules par ml ont été trouvé dans les échantillons
d’eau prélevés de la baie de Priolo (Sicilie) par Catania et collaborateurs (2015). Ces valeurs
sont plus élevées que celles observées au niveau du port de Sidi Fredj.
Figure 42. Abondance microbienne mesurée par DAPI count, dans les échantillons d’eau.
V.4 Les indices de diversité des échantillons d’eau et de sédiment par DGGE.

 
Afin de comparer la diversité bactérienne dans les échantillons d’eau de mer et de sédiments
prélevés dans le port de Sidi Fredj, une technique indépendante à la culture « DGGE » a été
réalisée. Les profils de diversité obtenus par cette méthode permettent d’estimer la diversité
microbienne et de comparer des communautés bactériennes des différents échantillons. La
DGGE (Denaturating Gradient Gel Electrophoresis) est basée sur la séparation de produits
1,00E+00
 
1,00E+01
 
1,00E+02
 
1,00E+03
 
1,00E+04
 
1,00E+05
 
1,00E+06
 
SW1
 
SW2
 
SW3
 
SW4
 
SW5
 
DAPI
  Count
  (Log
  Cell
  ml -­‐1
)