Chapitre III : La caractérisation de la phylogénie et de la résistance aux antibiotiques
des souches d’Escherichia coli isolées à partir de la moule « mytilus galloprovincialis ». :
Résultats et discussion
III Résultats et discussion :
III.1 Identification de l’espèce :
Les souches qui ont fait l’objet de cette étude sont des coliformes isolés en 2012 à partir des
moules sauvages (bateau casé), et des moules d’élevages (ORCA Marine). Leur identification
par galerie API20E a révélé l’appartenance de ces souches à l’espèce Escherichia coli
(tableau 5).
Tableau 5 : Identification des 24 coliformes isolés à partir de moules d’élevages et de moules
sauvages.
Souche
Numéro de code
Identification
Escherichia coli (MB13)
5044542
Bonne (98.1%)
Escherichia coli (MO1),
(MO2), (MO12), (MO18)
5044552
Très bonne (99.8%)
Escherichia coli (MB11)
5044572
Excellente (99.9%)
Escherichia coli (MO11)
5144152
Bonne (97.7%)
Escherichia coli (MB22)
5144500
Très bonne (79.9%)
Escherichia coli (MB12),
(MB9), (MB21),
5144552
Excellente (99.9%)
Escherichia coli (MO16)
5144562
Très bonne (99.8%)
Escherichia coli (MB1),
(MB3), (MO3), (MO17),
(MB7), (MO 14), (MB6),
(MB4),), (MO7), MO13),
5144572
Très bonne (99.5%)
Escherichia coli (MB6)
7144572
Très bonne (99.8%)
MO : La Moule d’élevage ORCA marine MB : La Moule sauvage Bateau casée.
III.2 Classification phylogénique des souches d’Escherichia coli :
Les souches d’Escherichia coli isolées à partir de la moule « Mytilus galloprovincialis »
peuvent être attribuées à quatre principaux groupes phylogénétiques: A, B1, B2 et D. Cette
classification nous a permes de répartir les souches en souches commensales et souches
pathogènes.
Pour déterminer ces quatre groupes phylogénétiques, une méthode basée sur la détection par
PCR de la présence ou de l'absence de deux gènes (chuA et yjaA) et un fragment d'ADN
anonyme (TSPE4.C2), utilisés comme des marqueurs génétiques (figure 9) (Clerrmont et al,
2000).
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