Annexe I
-63Mode opératoire de la méthode CTAB :
Solubilisation du tissu
Numéroter les tubes
Prendre un petit morceau de chair et le mettre dans l’eppendorf
Ajouter 400 µl de CTAB
Ajouter 20 µl de protéinase K
Vortexer et incuber à 56°C pendant 1-2h
Précipitation de protéine
Ajouter 400µl de chloroforme/isoamylol (24/1)
Vortexer
Centrifuger 14 000 rpm (18 000 rcf) pendant 30 minutes
A l’aide d’une pipette prélever la phase aqueuse et la transférer dans un autre tube
(V=400µl)
Précipitation de l’ADN
Ajouter 1/10 volume de Na OAC à 3M, pH=5.2 (V=400µl, 1/10v=40µl donc V f =440µl)
Ajouter 2 volumes d’Ethanol à 100% (Vf=440, 2V f =880µl)
Centrifuger 14 000 rpm (18 000 rcf) pendant 20 minutes
Vider les tubes et ne garder que le précipité qui apparait en blanc (pelote d’ADN)
Lavage à l’Ethanol 70%
Ajouter 1 ml d’Ethanol
Centrifuger 14 000 rpm (18 000 rcf) pendant 15 minutes
Vider les tubes de l’Ethanol
Sécher au speed vac pendant 15 minutes
Redissolution de l’ADN
Ajouter 200µl de tris EDTA à pH=8 et attendre quelque instant
Vortexer
Incuber à 55°C pendant quelques minutes
Mode opératoire de la méthode du kit Qiagen
Prélever un morceau de tissu et le mettre dans un tube
Ajouter 180 µl de buffer ATL
Ajouter 20 µl de protéinase K
Vortexer puis incuber à 56°C pendant 1-2h
Ajouter 200 µl de buffer AL et incuber à 56°C pendant 30 minutes
-63Mode opératoire de la méthode CTAB :
Solubilisation du tissu
Numéroter les tubes
Prendre un petit morceau de chair et le mettre dans l’eppendorf
Ajouter 400 µl de CTAB
Ajouter 20 µl de protéinase K
Vortexer et incuber à 56°C pendant 1-2h
Précipitation de protéine
Ajouter 400µl de chloroforme/isoamylol (24/1)
Vortexer
Centrifuger 14 000 rpm (18 000 rcf) pendant 30 minutes
A l’aide d’une pipette prélever la phase aqueuse et la transférer dans un autre tube
(V=400µl)
Précipitation de l’ADN
Ajouter 1/10 volume de Na OAC à 3M, pH=5.2 (V=400µl, 1/10v=40µl donc V f =440µl)
Ajouter 2 volumes d’Ethanol à 100% (Vf=440, 2V f =880µl)
Centrifuger 14 000 rpm (18 000 rcf) pendant 20 minutes
Vider les tubes et ne garder que le précipité qui apparait en blanc (pelote d’ADN)
Lavage à l’Ethanol 70%
Ajouter 1 ml d’Ethanol
Centrifuger 14 000 rpm (18 000 rcf) pendant 15 minutes
Vider les tubes de l’Ethanol
Sécher au speed vac pendant 15 minutes
Redissolution de l’ADN
Ajouter 200µl de tris EDTA à pH=8 et attendre quelque instant
Vortexer
Incuber à 55°C pendant quelques minutes
Mode opératoire de la méthode du kit Qiagen
Prélever un morceau de tissu et le mettre dans un tube
Ajouter 180 µl de buffer ATL
Ajouter 20 µl de protéinase K
Vortexer puis incuber à 56°C pendant 1-2h
Ajouter 200 µl de buffer AL et incuber à 56°C pendant 30 minutes
