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2. Méthode d’identification à l’échelle moléculaire
2.1. Par analyse des protéines ou la protéomique
La protéomique est une science récente qui étudie les protéines. Le terme « protéome »,
proposé en 1995, désigne l'ensemble des protéines exprimées par le génome d'une cellule,
d'un tissu ou encore d'un organe à un moment précis de son développement.
Même si le séquençage du génome humain est aujourd'hui achevé, l'étude du génome
comporte des limites. Sa connaissance ne permet pas d'appréhender la complexité du
fonctionnement cellulaire. Un même génome conduit à l'expression de plusieurs protéomes
en fonction des étapes du cycle cellulaire, de l'état physiopathologique de la cellule. Enfin,
les protéines peuvent subir de nombreuses modifications indépendamment de la seule
expression du gène codant.
L'analyse protéomique permet donc une description dynamique de la régulation de
l'expression génique, grâce à l'étude des protéines et de leurs modifications posttraductionnelles.
Les recherches ont été orienté du coté protéique plus spécifiquement les protéines
sarcoplasmiques ou « myogène », qui sont munis d’une spécificité très marqué pour chaque
espèce et sont facilement extractibles (Roubal, 1963). Pour l'identification des espèces
animales correspondant à des tissus musculaires dénaturés, on utilise aussi bien les protéines
des myofibrilles que celles du sarcoplasma.
L'introduction de l'étude de la variation protéique par électrophorèse dans les années soixante
a procuré la première base véritable à l'étude génétique des populations (Bernatchez, 1994).
2.1.1. Marqueurs Enzymatiques
Les marqueurs enzymatiques sont plus souvent désignés par le terme allozymes qui sont les
variations alléliques d’une enzyme. En effet, chaque individu diploïde possède deux
séquences d’ADN (une sur chaque chromosome homologue) correspondant à la même
enzyme, qui à la traduction, peuvent donner deux formes enzymatiques différentes ou
allozymes si les séquences sont différentes. Ces différences en séquences d’acides aminés
composant l’enzyme peuvent être mises en évidence par une électrophorèse (Chlaida, 2009).
Cependant, certains auteurs ont montré l’effet de l’environnement sur l’expression
enzymatique (Lemaire, et al, 2000).
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