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Figure II.32 : Schéma représentant les fréquences des distances génétiques à l’intérieur
d’une espèce (intraspécifique) et entre des espèces (interspécifiques). Ces variation peuvent
être chevauchantes (absence de « gap ») ou non chevauchantes (présence de « gap » (Okassa,
2010).
Application de Barcode moléculaire pour l’identification des poissons
Une étude a été menée par Rasmussen en 2009, son but est d’examiné la capacité du codage
à barres de l'ADN pour une identification fiable des espèces de saumon et de truite (genres
Oncorhynchus et Salmo) commercialement importantes en Amérique du Nord.
L'ADN a été extrait d'échantillons tissulaires utilisant un protocole automatisé à base de
silice, comme décrit dans (Ivanova, et al, 2006).
Après une amplification, les produits de la PCR ont été séparés sur gel d'agarose de 2%.
Les images ont été photographiées sous la lumière UV avec un AlphaImager 3400 imaging
system, enfin les produits de la PCR ont été séquencés avec Big-DyeTerminator version 3.1.
Pour déterminer si les écarts de barcode (barcode gaps) sont présents entre les espèces de
salmonidés examinée dans cette étude, les relations entre la divergence inter et intraspécifique ont été comparées pour chaque espèce.