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En 2010 Lakraet alont développé une Méthode de PCR RAPD pour détecter la variabilité
génétique interspécifique et la parenté génétique entre cinq Sciaenidés Indiens.
Parmi les 50 amorces arbitraires testées, huit ont été sélectionnés sur la base de la
reproductibilité et la résolution des profils de bandes dans les cinq espèces. Les huit amorces
ont amplifié un total de 85 loci dans la gamme de taille de 40 à 4697 bp. Le nombre de
bandes RAPD stables et claires générés par les amorces variait entre 9 et 12(Teletchea,
2009).
2.2.6. AFLP (Amplified Fragments Length Polymorphism)
La technique AFLP (Amplified Fragments Length Polymorphism) est une variante de la PCR
développé par Vos et ces collaborateurs en 1995.
Cette technique est basée sur la détection par des amplifications sélectives de fragments
d'ADN génomique digerés.
L'ADN est dans un premier temps digéré par deux enzymes de restriction coupant
respectivement au niveau d’ un site rare et d’un site fréquent .puis des adaptateurs spécifiques
des sites de restriction utilisés, sont fixés aux extrémités des fragments de restriction obtenus
.
Les amplifications sont réalisées à l’aide d’amorce définies d’après la séquence des
adaptateurs. Ces amorces portent sur leurs extrémités 3’-OH des extensions aléatoires de 1 à
3 bases permettant l’amplification sélective d’une partie seulement e la population des
fragments de restriction. Une pré-amplification est réalisée en premier à l’aide d’amorces
présentant une extension d’une base généralement (amorces+1). Le produit de cette préamplification sert de matrice pour l’amplification sélective à l’aide des amorces +3 (Tagu., et
al. 2003).
Les produits d’amplification sélective sont ensuite séparés sur gel de polyacrylamide en condition
dénaturantes .la détection des bondes d’AFLP est obtenus soit par coloration des gels a l’argent,
soit par autoradiographie ou émission de fluorescence (Tagu,et al., 2003).
En 2010 Lakraet alont développé une Méthode de PCR RAPD pour détecter la variabilité
génétique interspécifique et la parenté génétique entre cinq Sciaenidés Indiens.
Parmi les 50 amorces arbitraires testées, huit ont été sélectionnés sur la base de la
reproductibilité et la résolution des profils de bandes dans les cinq espèces. Les huit amorces
ont amplifié un total de 85 loci dans la gamme de taille de 40 à 4697 bp. Le nombre de
bandes RAPD stables et claires générés par les amorces variait entre 9 et 12(Teletchea,
2009).
2.2.6. AFLP (Amplified Fragments Length Polymorphism)
La technique AFLP (Amplified Fragments Length Polymorphism) est une variante de la PCR
développé par Vos et ces collaborateurs en 1995.
Cette technique est basée sur la détection par des amplifications sélectives de fragments
d'ADN génomique digerés.
L'ADN est dans un premier temps digéré par deux enzymes de restriction coupant
respectivement au niveau d’ un site rare et d’un site fréquent .puis des adaptateurs spécifiques
des sites de restriction utilisés, sont fixés aux extrémités des fragments de restriction obtenus
.
Les amplifications sont réalisées à l’aide d’amorce définies d’après la séquence des
adaptateurs. Ces amorces portent sur leurs extrémités 3’-OH des extensions aléatoires de 1 à
3 bases permettant l’amplification sélective d’une partie seulement e la population des
fragments de restriction. Une pré-amplification est réalisée en premier à l’aide d’amorces
présentant une extension d’une base généralement (amorces+1). Le produit de cette préamplification sert de matrice pour l’amplification sélective à l’aide des amorces +3 (Tagu., et
al. 2003).
Les produits d’amplification sélective sont ensuite séparés sur gel de polyacrylamide en condition
dénaturantes .la détection des bondes d’AFLP est obtenus soit par coloration des gels a l’argent,
soit par autoradiographie ou émission de fluorescence (Tagu,et al., 2003).