Liste des figures
Figure 1 : Dendrogramme ARNr 16S de la position phylogénétique d'Ebterococcus
(adapté de Klein, 2003). ............................................................................................................. 3
Figure 2 : Enterococcus faecalis au microscope électronique. United States Department
of Agriculture (2019). ................................................................................................................ 4
Figure 3: Les modes d'action des antibiotiques Inserm/Koulikoff, Frédérique (2017). ............. 8
Figure 4: Schéma illustrant les différents mécanismes de résistance aux antibiotiques
(Springernature.com, 2004). ....................................................................................................... 9
Figure 5 : Mécanismes génétiques de dissémination de la résistance aux antibiotiques
(Springernature.com, 2004). ..................................................................................................... 11
Figure 6 : Situation géographique des sites de prélèvement (ArcGis). .................................... 18
Figure 7 : Galerie Api 20E (ephytia.inra.fr/2016). ................................................................... 28
Figure 8 : Schéma de la disposition des disques d'antibiotiques. ............................................. 31
Figure 9 : Résultat du dénombrement des coliformes. ............................................................. 32
Figure 10 : Résultats du dénombrement des coliformes totaux dans le sédiment. ................... 34
Figure 11 : Résultats de présence d'E.coli dans le sédiment d'Ain Taya à gauche et celui
de Sidi Fredj et bateau cassé à droite. ...................................................................................... 35
Figure 12 : Résultats de croissance sur la gélose Slanetz et Bartley. ....................................... 36
Figure 13 : Résultats de croissance sur la gélose BEA. ........................................................... 36
Figure 14 : Evolution des entérocoques dans les six plages au mois de Mai et de Juin. ......... 37
Figure 15 : Variation des concentrations d'entérocoques fécaux dans les sédiments
étudiés. ...................................................................................................................................... 38
Figure 16 : Résultats d'identification des souches isolées pour la galerie API 20E. ................ 39
Figure 17 : Taux de résistance aux antibiotiques dans les six plages pour le
prélèvement du mois de Mai. ................................................................................................... 40
Figure 18 : Taux de résistance aux antibiotiques dans les six plages pour le
prélèvement du mois de Juin. ................................................................................................... 41
Figure 19 : Résultats de croissance d'entérocoques isolés du sédiment. .................................. 42
Figure 20 : Taux de résistance aux antibiotiques dans les six plages par rapport aux
sédiments. ................................................................................................................................. 43
Figure 21 : Aspect microscopique des souches entérocoques isolées après coloration de
Gram (Gr *100). ....................................................................................................................... 44
Figure 22 : Résultats des différents tests classiques. ................................................................ 46
Figure 23 : Prévalence de la résistance aux antibiotiques de 28 souches isolées. .................... 47
Figure 24 : Illustration des résultats de l'antibiogramme pour la souche S1. ........................... 48
Figure 1 : Dendrogramme ARNr 16S de la position phylogénétique d'Ebterococcus
(adapté de Klein, 2003). ............................................................................................................. 3
Figure 2 : Enterococcus faecalis au microscope électronique. United States Department
of Agriculture (2019). ................................................................................................................ 4
Figure 3: Les modes d'action des antibiotiques Inserm/Koulikoff, Frédérique (2017). ............. 8
Figure 4: Schéma illustrant les différents mécanismes de résistance aux antibiotiques
(Springernature.com, 2004). ....................................................................................................... 9
Figure 5 : Mécanismes génétiques de dissémination de la résistance aux antibiotiques
(Springernature.com, 2004). ..................................................................................................... 11
Figure 6 : Situation géographique des sites de prélèvement (ArcGis). .................................... 18
Figure 7 : Galerie Api 20E (ephytia.inra.fr/2016). ................................................................... 28
Figure 8 : Schéma de la disposition des disques d'antibiotiques. ............................................. 31
Figure 9 : Résultat du dénombrement des coliformes. ............................................................. 32
Figure 10 : Résultats du dénombrement des coliformes totaux dans le sédiment. ................... 34
Figure 11 : Résultats de présence d'E.coli dans le sédiment d'Ain Taya à gauche et celui
de Sidi Fredj et bateau cassé à droite. ...................................................................................... 35
Figure 12 : Résultats de croissance sur la gélose Slanetz et Bartley. ....................................... 36
Figure 13 : Résultats de croissance sur la gélose BEA. ........................................................... 36
Figure 14 : Evolution des entérocoques dans les six plages au mois de Mai et de Juin. ......... 37
Figure 15 : Variation des concentrations d'entérocoques fécaux dans les sédiments
étudiés. ...................................................................................................................................... 38
Figure 16 : Résultats d'identification des souches isolées pour la galerie API 20E. ................ 39
Figure 17 : Taux de résistance aux antibiotiques dans les six plages pour le
prélèvement du mois de Mai. ................................................................................................... 40
Figure 18 : Taux de résistance aux antibiotiques dans les six plages pour le
prélèvement du mois de Juin. ................................................................................................... 41
Figure 19 : Résultats de croissance d'entérocoques isolés du sédiment. .................................. 42
Figure 20 : Taux de résistance aux antibiotiques dans les six plages par rapport aux
sédiments. ................................................................................................................................. 43
Figure 21 : Aspect microscopique des souches entérocoques isolées après coloration de
Gram (Gr *100). ....................................................................................................................... 44
Figure 22 : Résultats des différents tests classiques. ................................................................ 46
Figure 23 : Prévalence de la résistance aux antibiotiques de 28 souches isolées. .................... 47
Figure 24 : Illustration des résultats de l'antibiogramme pour la souche S1. ........................... 48