Annexes. Installation de R et de ses packages
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– pour un package (par exemple Rcmdr) dont le fichier est sur le site internet
CRAN :
install.packages("Rcmdr")
Une autre possibilit´ e est d’installer un package sans passer par R, c’est-` a-dire
directement depuis une fenˆ etre de commandes MS-DOS sous Microsoft, ou une
fenˆ etre de terminal sous Linux ou MacOS. Mais dans ce dernier cas, vous aurez
besoin de nombreux outils de compilation. Si ces outils ne sont pas install´ es
sur votre ordinateur, reportez-vous au paragraphe sur la cr´ eation de packages
dans le chapitre 7.
Si ces outils sont install´ es sur votre ordinateur, vous pouvez essayer ceci :
T´ el´ echargez par exemple le fichier (package source) Rcmdr_numero.tar.gz
` a partir de cette adresse internet : http://cran.r-project.org/web/packages/
Rcmdr.
Enregistrez-le (sur le bureau) et lancez une fenˆ etre de commande MS-DOS
(Menu D´ emarrer/Ex´ ecuter/cmd), puis tapez :
cd Bureau
R CMD INSTALL Rcmdr_numero.tar.gz (remplacez bien entendu numero par
ce qu’il faut).
C.2.4 Installation de packages sous Linux
Notez que les commandes de la section pr´ ec´ edente fonctionnent ´ egalement
sous Linux. Mais leur utilisation n´ ecessite parfois d’ˆ etre connect´ e en tant que
super-utilisateur root (commande su - ` a taper dans une fenˆ etre de terminal).
Si vous ne disposez pas des droits d’acc` es root, vous pouvez choisir d’installer des packages localement, c’est-` a-dire dans votre r´ epertoire personnel (home
directory). Par exemple, pour le package Rcmdr, tapez dans un terminal :
R CMD INSTALL --library=/home/user/Rlibs Rcmdr_numero.tar.gz
(o` u, apr` es que vous avez cr´ e´ e le dossier Rlibs au moyen de la commande
mkdir Rlibs, le chemin /home/user/Rlibs devra ˆ etre remplac´ e par le chemin
appropri´ e et numero devra ´ egalement ˆ etre remplac´ e par ce qu’il faut).
Ensuite, afin que R puisse savoir o` u chercher les packages que vous aurez
install´ es, il vous faut cr´ eer un fichier nomm´ e ∼/.Renviron qui devra contenir la
ligne
R_LIBS=/home/user/Rlibs
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– pour un package (par exemple Rcmdr) dont le fichier est sur le site internet
CRAN :
install.packages("Rcmdr")
Une autre possibilit´ e est d’installer un package sans passer par R, c’est-` a-dire
directement depuis une fenˆ etre de commandes MS-DOS sous Microsoft, ou une
fenˆ etre de terminal sous Linux ou MacOS. Mais dans ce dernier cas, vous aurez
besoin de nombreux outils de compilation. Si ces outils ne sont pas install´ es
sur votre ordinateur, reportez-vous au paragraphe sur la cr´ eation de packages
dans le chapitre 7.
Si ces outils sont install´ es sur votre ordinateur, vous pouvez essayer ceci :
T´ el´ echargez par exemple le fichier (package source) Rcmdr_numero.tar.gz
` a partir de cette adresse internet : http://cran.r-project.org/web/packages/
Rcmdr.
Enregistrez-le (sur le bureau) et lancez une fenˆ etre de commande MS-DOS
(Menu D´ emarrer/Ex´ ecuter/cmd), puis tapez :
cd Bureau
R CMD INSTALL Rcmdr_numero.tar.gz (remplacez bien entendu numero par
ce qu’il faut).
C.2.4 Installation de packages sous Linux
Notez que les commandes de la section pr´ ec´ edente fonctionnent ´ egalement
sous Linux. Mais leur utilisation n´ ecessite parfois d’ˆ etre connect´ e en tant que
super-utilisateur root (commande su - ` a taper dans une fenˆ etre de terminal).
Si vous ne disposez pas des droits d’acc` es root, vous pouvez choisir d’installer des packages localement, c’est-` a-dire dans votre r´ epertoire personnel (home
directory). Par exemple, pour le package Rcmdr, tapez dans un terminal :
R CMD INSTALL --library=/home/user/Rlibs Rcmdr_numero.tar.gz
(o` u, apr` es que vous avez cr´ e´ e le dossier Rlibs au moyen de la commande
mkdir Rlibs, le chemin /home/user/Rlibs devra ˆ etre remplac´ e par le chemin
appropri´ e et numero devra ´ egalement ˆ etre remplac´ e par ce qu’il faut).
Ensuite, afin que R puisse savoir o` u chercher les packages que vous aurez
install´ es, il vous faut cr´ eer un fichier nomm´ e ∼/.Renviron qui devra contenir la
ligne
R_LIBS=/home/user/Rlibs