2.12 What Are Monoclonal Antibodies? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
2.13 DNA Sequencing and Marine Omics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51
2.14 Chapter Summary and Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52
References . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52
3 Fish Genetics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
3.1 Gene Expression in Fish and Other Eukaryotes . . . . . . . . . . . . 55
3.2 Recombinant DNA Technology . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58
3.3 Cloning of a Target Gene . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
3.4 Fish Genes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
3.5 Fish Gene Structures . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66
3.6 New Analyses of Fish Genomes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71
3.6.1 Importance of Fish Genome Analysis . . . . . . . . . . . . . 71
3.6.2 Trends in New Genomic Analysis Technology . . . . . . 72
3.6.3 Genome Decoding Process . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73
3.6.4 Future of Fish Genomics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
3.7 Chapter Summary and Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75
References . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 76
4 Fish Breeding and Biotechnology . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79
4.1 The Global Food Shortage and Genetic Engineering . . . . . . . . . 79
4.2 Chromosome Manipulation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81
4.2.1 Basic Techniques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
4.2.2 Example of Application . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85
4.3 Cell Manipulation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88
4.3.1 Basic Techniques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89
4.3.2 Applications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91
4.4 Gene Manipulation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 96
4.4.1 Basic Techniques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97
4.4.2 Examples of Applications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 102
4.5 Chapter Summary and Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105
References . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
5 Genetic Diversity and DNA Markers in Fish . . . . . . . . . . . . . . . . . 109
5.1 The Meaning of Genetic Diversity . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109
5.2 Genetic Diversity and Marine Organism Resources . . . . . . . . . . 111
5.3 What Are Genetic Markers? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 112
5.4 DNA Polymorph Detection Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115
5.5 Genetic Analysis Through DNA Markers . . . . . . . . . . . . . . . . . 118
5.5.1 Mitochondrial DNA Haplotype Polymorphs . . . . . . . . . 118
5.5.2 DNA Fingerprinting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
xiv
Contents