2.2. La vie et ses contraintes
13 GRANDS CODONS DANS
4 cases avec 1 grand codon
3 cases avec 2 grands codons
1 case avec 3 grands codons
A
A
AA G
GA G
T
T
AA c
GA c
2 gr~nds ·~c·ci•Jns
2 grands codons
A
A
AG G
GG G
T
T
AG c
c
2 grands cc.dons
1 grand codon
-·
··-1 AT A
A
1 - - - - - GT
AT G
G
-------·-----T
T
AT c
c
-----------3 1!1l r and:: codons
1 gr ancl codon
A
A
AC G
GG G
T
T
c
c
1 9' ~~·? c ~dc•n
1 gr and .: od•Jr1
13GRANDSCODONSDANS
4 cases avec 1 grand codon
3 cases avec 2 grands codons
1 case avec 3 grands codons
A
A
TA G
CA G
T
T
TA c
CA c
2 grG~I"lds codons
2 grBnds codons
TG A
-
A
TG G
CG G
•··--··-··-·------~ 1
T
1
T
TG c
c
~-------~-~-----~ C1!~-~d-~..codon§_ __ :
1 gr .;!nd codon
A
A
TT G
CT G
T
TT c
c
2 grands codons
1 9r ::~nd codon
A
A
TC G
cc G
T
T
c
c
1 gt and o:c•don
1 gr~n~ coJdon
Figure 2.3. Le nouveau tableau symétrique du code génétique (d'après J.-Y.
Bou/ayes, 2001-2004).
95
Lorsqu'il y a des codons synonymes, on constate que les deux premiers
nucléotides du triplet codant un acide aminé sont les mêmes et semblent
donc suffire à la codification, seul le troisième nucléotide présente une
différence dont la fonction est complexe. Cette troisième base du codon
est en général reconnue par une base inhabituelle de l'autre codon sur
l'ARNt, la xanthine, présente dans le nucléoside I (inosine) et qui peut
s'hybrider avec A, U et C. Jukes considérait cette 3e base comme un
simple élément de ponctuation. S'il en était ainsi, les 3e bases distinctes
impliqueraient une dérivation spécialisée à partir d'un code génétique
ancestral.
Qu'est-ce que cela signifie au point de vue évolutif? D'après le diagramme des deux séries, il semble se dégager deux pics de probabilité
à 2 et à 4 codons qui pourraient correspondre à des pics de probabilité de
structuration impliqués par le diagramme de Nottale « énergie/complexergie dans les espaces standard et des échelles » que nous verrons plus loin
(fig. 2.6) et retenu ensuite par la sélection naturelle.
Pourquoi la thymine de l'ADN est-elle remplacée par l'uracile U dans
l'ARNm Nous avons évoqué une désamination spontanée de la cytosine
en uracile, détectée par les systèmes de réparation de l'ADN, là où l'uracile
n'existe pas normalement et est remplacée par T. Par contre dans l'ARN,
13 GRANDS CODONS DANS
4 cases avec 1 grand codon
3 cases avec 2 grands codons
1 case avec 3 grands codons
A
A
AA G
GA G
T
T
AA c
GA c
2 gr~nds ·~c·ci•Jns
2 grands codons
A
A
AG G
GG G
T
T
AG c
c
2 grands cc.dons
1 grand codon
-·
··-1 AT A
A
1 - - - - - GT
AT G
G
-------·-----T
T
AT c
c
-----------3 1!1l r and:: codons
1 gr ancl codon
A
A
AC G
GG G
T
T
c
c
1 9' ~~·? c ~dc•n
1 gr and .: od•Jr1
13GRANDSCODONSDANS
4 cases avec 1 grand codon
3 cases avec 2 grands codons
1 case avec 3 grands codons
A
A
TA G
CA G
T
T
TA c
CA c
2 grG~I"lds codons
2 grBnds codons
TG A
-
A
TG G
CG G
•··--··-··-·------~ 1
T
1
T
TG c
c
~-------~-~-----~ C1!~-~d-~..codon§_ __ :
1 gr .;!nd codon
A
A
TT G
CT G
T
TT c
c
2 grands codons
1 9r ::~nd codon
A
A
TC G
cc G
T
T
c
c
1 gt and o:c•don
1 gr~n~ coJdon
Figure 2.3. Le nouveau tableau symétrique du code génétique (d'après J.-Y.
Bou/ayes, 2001-2004).
95
Lorsqu'il y a des codons synonymes, on constate que les deux premiers
nucléotides du triplet codant un acide aminé sont les mêmes et semblent
donc suffire à la codification, seul le troisième nucléotide présente une
différence dont la fonction est complexe. Cette troisième base du codon
est en général reconnue par une base inhabituelle de l'autre codon sur
l'ARNt, la xanthine, présente dans le nucléoside I (inosine) et qui peut
s'hybrider avec A, U et C. Jukes considérait cette 3e base comme un
simple élément de ponctuation. S'il en était ainsi, les 3e bases distinctes
impliqueraient une dérivation spécialisée à partir d'un code génétique
ancestral.
Qu'est-ce que cela signifie au point de vue évolutif? D'après le diagramme des deux séries, il semble se dégager deux pics de probabilité
à 2 et à 4 codons qui pourraient correspondre à des pics de probabilité de
structuration impliqués par le diagramme de Nottale « énergie/complexergie dans les espaces standard et des échelles » que nous verrons plus loin
(fig. 2.6) et retenu ensuite par la sélection naturelle.
Pourquoi la thymine de l'ADN est-elle remplacée par l'uracile U dans
l'ARNm Nous avons évoqué une désamination spontanée de la cytosine
en uracile, détectée par les systèmes de réparation de l'ADN, là où l'uracile
n'existe pas normalement et est remplacée par T. Par contre dans l'ARN,