208 Chimie pour les étudiants en médecine ...
CH20H
1
OH
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OH
Le désoxyribose, l'ose
qui se trouve dans l'ADN.
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01-1 o / 'oHN
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GMP
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cyclique H /
p�O
OH o / 'Qles fo rmules de deux
importants phosphodiesters
(l'AMPc et le GMPc), qui sont
des messagers chimiques.
les bases sont soit des purines, en l'occurrence de la guanine ou de
l'adénine, soit des pyrimidines, l'uracile ou la cytosine. Dans les acides
désoxynucléiques, le ribose est modifié en désoxyribose (voir dans la
marge) par l'enlèvement de !'hydroxyle porté par le carbone 2, et l'uracile est remplacée par une autre base possible, à savoir la thymine.
Les protéines sont capables de former des esters phosphoriques en
faisant intervenir les groupes hydroxyle des chaînes latérales de leurs
sérines et tyrosines. Ces formations d'esters phosphoriques peuvent
avoir des conséquences considérables sur l'activité enzymatique de certaines protéines, par exemple avec la glycogène-phosphorylase, parce
que la conformation de la molécule s'en trouve fortement affectée.
Les esters phosphoriques peuvent être réestérifiés par un nouvel
alcool, ce qui aboutit à la formation d'un phosphodiester :
ROH + R'opœ- � RO(R'O)P02 + OHParmi les importants phosphodiesters, on se doit de citer des
nucléotides cycliques comme l'adénosine-3;5' -monophosphate cyclique
(AMP cyclique) et la guanosine-3;5'-monophosphate cyclique (GMP
cyclique), qui servent de messagers chimiques (voir dans la marge).
Les phosphodiesters jouent un rôle fondamental en accrochant l'un à
l'autre les divers nucléotides dans l' ADN ou dans l'ARN (figure 12.7, le
pont phosphodiester étant en gras). Le pK de l'oxygène titrable du phosphodiester se situe entre 1 et 2. De ce fait, au pH physiologique, seul l'ion
phosphodiester existe en pratique. Ceci confère à l' ADN et à l'ARN
une charge globale négative à pH neutre. Les groupes phosphate de ces
phosphodiesters peuvent donc former des liaisons ioniques avec des
protéines positives, comme les histones qui ont pour mission de se lier
aux doubles hélices d' ADN.
Des ponts phosphodiester font également partie des composants
hydrophiles des phospholipides. Il a été question des lipides dans le
chapitre 9. Les diacylglycérols contiennent un groupe hydroxyle libre
qui peut être estérifié par un phosphate, ce qui fournit un acide phosphatidique :
Nucléotlde-5' -triphosphate
Nucléotide-5' -diphosphate
Nucléotide-5' -monophosphate
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N
Y
0 ,
lH2-o- r -or - ; - o- P-OH
Base
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OH OH
Ose
Figure 12.6 La relation qui existe entre base, nucléoside et nucléotide, dans
le cadre de l'exemple de l'adénosine-5'-tri phosphate (ATP).
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(l'AMPc et le GMPc), qui sont
des messagers chimiques.
les bases sont soit des purines, en l'occurrence de la guanine ou de
l'adénine, soit des pyrimidines, l'uracile ou la cytosine. Dans les acides
désoxynucléiques, le ribose est modifié en désoxyribose (voir dans la
marge) par l'enlèvement de !'hydroxyle porté par le carbone 2, et l'uracile est remplacée par une autre base possible, à savoir la thymine.
Les protéines sont capables de former des esters phosphoriques en
faisant intervenir les groupes hydroxyle des chaînes latérales de leurs
sérines et tyrosines. Ces formations d'esters phosphoriques peuvent
avoir des conséquences considérables sur l'activité enzymatique de certaines protéines, par exemple avec la glycogène-phosphorylase, parce
que la conformation de la molécule s'en trouve fortement affectée.
Les esters phosphoriques peuvent être réestérifiés par un nouvel
alcool, ce qui aboutit à la formation d'un phosphodiester :
ROH + R'opœ- � RO(R'O)P02 + OHParmi les importants phosphodiesters, on se doit de citer des
nucléotides cycliques comme l'adénosine-3;5' -monophosphate cyclique
(AMP cyclique) et la guanosine-3;5'-monophosphate cyclique (GMP
cyclique), qui servent de messagers chimiques (voir dans la marge).
Les phosphodiesters jouent un rôle fondamental en accrochant l'un à
l'autre les divers nucléotides dans l' ADN ou dans l'ARN (figure 12.7, le
pont phosphodiester étant en gras). Le pK de l'oxygène titrable du phosphodiester se situe entre 1 et 2. De ce fait, au pH physiologique, seul l'ion
phosphodiester existe en pratique. Ceci confère à l' ADN et à l'ARN
une charge globale négative à pH neutre. Les groupes phosphate de ces
phosphodiesters peuvent donc former des liaisons ioniques avec des
protéines positives, comme les histones qui ont pour mission de se lier
aux doubles hélices d' ADN.
Des ponts phosphodiester font également partie des composants
hydrophiles des phospholipides. Il a été question des lipides dans le
chapitre 9. Les diacylglycérols contiennent un groupe hydroxyle libre
qui peut être estérifié par un phosphate, ce qui fournit un acide phosphatidique :
Nucléotlde-5' -triphosphate
Nucléotide-5' -diphosphate
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Figure 12.6 La relation qui existe entre base, nucléoside et nucléotide, dans
le cadre de l'exemple de l'adénosine-5'-tri phosphate (ATP).