Une façon beaucoup plus utilisée de nos jours pour déterminer l’acide aminé
N-terminal est la dégradation d’Edman (nommée ainsi en l’honneur du biochimiste
suédois Pehr Victor Edman [1916-1977], qui publia cette méthode en 1950 ; méthode
qui sera automatisée en 1967). Cette réaction offre l’avantage de n’enlever que le résidu
N-terminal tout en laissant intact le reste de la chaîne peptidique. Le processus peut
être répété, permettant ainsi d’établir la séquence des résidus d’acides aminés d’un peptide à partir de l’extrémité N-terminale. Cette dégradation utilise l’isothiocyanate de
phényle, C 6 H 5 ONPCPS, appelé réactif d’Edman. Les étapes décrivant le marquage
sélectif et la libération de l’acide aminé N-terminal sont présentées dans la ?gure 6.28.
L’acide aminé N-terminal se lie d’abord au carbone thiocarbonylique du réactif pour
former un dérivé phénylthiocarbamoyle. Cette étape est suivie d’une hydrolyse acide
modérée (pour ne pas hydrolyser les liaisons peptidiques), ce qui libère l’acide aminé
N-terminal sous la forme d’un dérivé phénylthiohydantoïne (PTH) (le mécanisme de
cette réaction ne sera pas démontré). Le dérivé ainsi formé peut ensuite être identi?é
par comparaison avec des composés de référence préparés séparément à partir d’acides
aminés connus.
Figure 6.28 Dégradation d’Edman sur un peptide
Le peptide restant après cette première dégradation peut être soumis de nouveau
au même processus a?n de déterminer l’identité de l’acide aminé qui suit, et ainsi de
suite. La méthode est aujourd’hui automatisée et permet de déterminer les quelque
50 premiers résidus d’acides aminés d’un peptide (le processus ne peut être continué
davantage en raison de l’accumulation d’impuretés).
Exemple 6.8
L’angiotensine II est un octapeptide intervenant dans le maintien de la tension
artérielle. Ce peptide contient un résidu d’acide aspartique à l’extrémité N-terminale
et un résidu de phénylalanine à l’extrémité C-terminale. Déterminez la formule du
premier dérivé phénylthiohydantoïne produit par une dégradation d’Edman.
Solution
La dégradation d’Edman intervient sur l’extrémité N-terminale. Le dérivé
phénylthiohydantoïne de l’acide aspartique sera obtenu (voir la structure en marge).
278 Chapitre 6 Protides
N-terminal est la dégradation d’Edman (nommée ainsi en l’honneur du biochimiste
suédois Pehr Victor Edman [1916-1977], qui publia cette méthode en 1950 ; méthode
qui sera automatisée en 1967). Cette réaction offre l’avantage de n’enlever que le résidu
N-terminal tout en laissant intact le reste de la chaîne peptidique. Le processus peut
être répété, permettant ainsi d’établir la séquence des résidus d’acides aminés d’un peptide à partir de l’extrémité N-terminale. Cette dégradation utilise l’isothiocyanate de
phényle, C 6 H 5 ONPCPS, appelé réactif d’Edman. Les étapes décrivant le marquage
sélectif et la libération de l’acide aminé N-terminal sont présentées dans la ?gure 6.28.
L’acide aminé N-terminal se lie d’abord au carbone thiocarbonylique du réactif pour
former un dérivé phénylthiocarbamoyle. Cette étape est suivie d’une hydrolyse acide
modérée (pour ne pas hydrolyser les liaisons peptidiques), ce qui libère l’acide aminé
N-terminal sous la forme d’un dérivé phénylthiohydantoïne (PTH) (le mécanisme de
cette réaction ne sera pas démontré). Le dérivé ainsi formé peut ensuite être identi?é
par comparaison avec des composés de référence préparés séparément à partir d’acides
aminés connus.
Figure 6.28 Dégradation d’Edman sur un peptide
Le peptide restant après cette première dégradation peut être soumis de nouveau
au même processus a?n de déterminer l’identité de l’acide aminé qui suit, et ainsi de
suite. La méthode est aujourd’hui automatisée et permet de déterminer les quelque
50 premiers résidus d’acides aminés d’un peptide (le processus ne peut être continué
davantage en raison de l’accumulation d’impuretés).
Exemple 6.8
L’angiotensine II est un octapeptide intervenant dans le maintien de la tension
artérielle. Ce peptide contient un résidu d’acide aspartique à l’extrémité N-terminale
et un résidu de phénylalanine à l’extrémité C-terminale. Déterminez la formule du
premier dérivé phénylthiohydantoïne produit par une dégradation d’Edman.
Solution
La dégradation d’Edman intervient sur l’extrémité N-terminale. Le dérivé
phénylthiohydantoïne de l’acide aspartique sera obtenu (voir la structure en marge).
278 Chapitre 6 Protides