Régime de production primaire dans le bassin algérien : interaction facteurs du milieu successions planctoniques
| Matériel et méthodes
2.4.4.2 Matrices initiales
Trois matrices sont nécessaires pour le logiciel CHEMTAX : la matrice des rapports initiaux
(F 0 ), la matrice des limites des rapports et la matrice de données (S) contenant les
concentrations de pigments HPLC.
• Matrice des ratios pigmentaires (F 0 )
Contient les rapports pigmentaires utilisés comme point de départ pour les calculs
CHEMTAX. La construction de la matrice (F 0 ) requiert une attention particulière si l’on veut
obtenir des résultats cohérents. Idéalement, les ratios de départ devraient être obtenus à partir
de cultures collectées sur le site d'étude (Laza-Martinez et al., 2007), bien que les ratios de
pigments soient généralement basés sur les valeurs de la littérature.
La matrice (F 0 ) ne doit pas être linéairement dépendante ; le nombre de pigments utilisés doit
être supérieur au nombre de classes phytoplanctoniques considérées. Néanmoins, si le nombre
de pigments est supérieur au nombre de classes phytoplanctoniques, des longues itérations
peuvent survenir. Idéalement, le nombre de pigments doit être 2 à 3 fois plus grand que le
nombre de classes phytoplanctoniques. Le choix des pigments à utiliser dans la matrice de
rapport doit également être effectué avec précaution. Les pigments présents dans la quasitotalité du phytoplancton ont peu de chances de fournir des informations utiles.
Il est également important que chaque grande classe de pigments phytoplanctoniques
susceptible d'être présente dans les échantillons de données soit représentée dans la matrice
des rapports. Chaque classe de phytoplancton utilisée doit également comporter, de
préférence, au moins deux pigments en plus de la Chl a, et les pigments « marqueurs »
donneront de meilleurs résultats que les pigments à large distribution.
En se basant sur les pigments présents dans notre jeu de données et sur les études antérieures
en MO, la matrice des rapports (F 0 ) a été construite à partir des valeurs de la littérature
proposées par Mackey et al. (1996) et Higgins et al. (2011), utilisées précédemment pour des
échantillons méditerranéens (Bustillos-Guzman et al., 1995 ; Claustre et al., 1994 ; Marty et
al., 2002 ; Vidussi et al., 2000). Finalement, la matrice (F 0 ) utilisée dans cette étude est
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2.4.4.2 Matrices initiales
Trois matrices sont nécessaires pour le logiciel CHEMTAX : la matrice des rapports initiaux
(F 0 ), la matrice des limites des rapports et la matrice de données (S) contenant les
concentrations de pigments HPLC.
• Matrice des ratios pigmentaires (F 0 )
Contient les rapports pigmentaires utilisés comme point de départ pour les calculs
CHEMTAX. La construction de la matrice (F 0 ) requiert une attention particulière si l’on veut
obtenir des résultats cohérents. Idéalement, les ratios de départ devraient être obtenus à partir
de cultures collectées sur le site d'étude (Laza-Martinez et al., 2007), bien que les ratios de
pigments soient généralement basés sur les valeurs de la littérature.
La matrice (F 0 ) ne doit pas être linéairement dépendante ; le nombre de pigments utilisés doit
être supérieur au nombre de classes phytoplanctoniques considérées. Néanmoins, si le nombre
de pigments est supérieur au nombre de classes phytoplanctoniques, des longues itérations
peuvent survenir. Idéalement, le nombre de pigments doit être 2 à 3 fois plus grand que le
nombre de classes phytoplanctoniques. Le choix des pigments à utiliser dans la matrice de
rapport doit également être effectué avec précaution. Les pigments présents dans la quasitotalité du phytoplancton ont peu de chances de fournir des informations utiles.
Il est également important que chaque grande classe de pigments phytoplanctoniques
susceptible d'être présente dans les échantillons de données soit représentée dans la matrice
des rapports. Chaque classe de phytoplancton utilisée doit également comporter, de
préférence, au moins deux pigments en plus de la Chl a, et les pigments « marqueurs »
donneront de meilleurs résultats que les pigments à large distribution.
En se basant sur les pigments présents dans notre jeu de données et sur les études antérieures
en MO, la matrice des rapports (F 0 ) a été construite à partir des valeurs de la littérature
proposées par Mackey et al. (1996) et Higgins et al. (2011), utilisées précédemment pour des
échantillons méditerranéens (Bustillos-Guzman et al., 1995 ; Claustre et al., 1994 ; Marty et
al., 2002 ; Vidussi et al., 2000). Finalement, la matrice (F 0 ) utilisée dans cette étude est
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