Régime de production primaire dans le bassin algérien : interaction facteurs du milieu successions planctoniques
| Matériel et méthodes
concentration en pigments totaux (TP), et qu'il existait une régression entre TChl a et AP avec
r² = 0,95 et une pente de 1,03. Cela implique la bonne qualité des mesures.
2.3
Interprétation quantitative des données de pigments chimiotaxonomiques
L'utilisation des pigments pour l'analyse chimiotaxonomique quantitative des populations de
phytoplancton a débuté dans les années 1970, lorsque la chromatographie sur couche mince a
révélé une grande diversité de pigments dans le phytoplancton (Jeffrey, 1974). Depuis lors, les
progrès de la systématique du phytoplancton, notamment grâce à l'analyse de l'ADN
(exemple : Karlson et al., 2010), ont révélé une diversité taxonomique du phytoplancton bien
plus grande qu'on ne l'imaginait auparavant, tandis que les améliorations simultanées de la
chromatographie ont conduit à l'identification de plus de 70 pigments dans 45 patrons
pigmentaires (Jeffrey et al., 2013). Cela confère une puissance supplémentaire considérable à
l'analyse des pigments, mais complique aussi considérablement leur interprétation.
Relativement, peu de pigments sont aujourd'hui considérés comme des marqueurs univoques,
la plupart étant répartis entre plusieurs taxons.
Il est difficile de prédire avec précision la teneur en pigments d'une population sur le terrain,
même si l'on connaît les espèces présentes à cause de la variabilité du contenu pigmentaire en
fonction des facteurs environnementaux et au sein des espèces (mêmes genres ou souches de
la même espèce). Néanmoins, les pigments restent des marqueurs chimiotaxonomiques
précieux pour les taxons d'algues, en particulier pour le pico et le nanophytoplancton, qui sont
difficiles à identifier au microscope. La force de l'analyse des pigments réside dans
l'identification et la cartographie des populations au sein d'un ensemble de données, qu'il
s'agisse de régions dans le cadre d'une étude géographique ou d'une succession de populations
dans le cadre d'une étude temporelle.
Cette partie traite de l'interprétation des données pigmentaires sur le terrain, notamment du
statut des différents marqueurs pigmentaires et des outils disponibles pour leur interprétation
quantitative.
46
| Matériel et méthodes
concentration en pigments totaux (TP), et qu'il existait une régression entre TChl a et AP avec
r² = 0,95 et une pente de 1,03. Cela implique la bonne qualité des mesures.
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Interprétation quantitative des données de pigments chimiotaxonomiques
L'utilisation des pigments pour l'analyse chimiotaxonomique quantitative des populations de
phytoplancton a débuté dans les années 1970, lorsque la chromatographie sur couche mince a
révélé une grande diversité de pigments dans le phytoplancton (Jeffrey, 1974). Depuis lors, les
progrès de la systématique du phytoplancton, notamment grâce à l'analyse de l'ADN
(exemple : Karlson et al., 2010), ont révélé une diversité taxonomique du phytoplancton bien
plus grande qu'on ne l'imaginait auparavant, tandis que les améliorations simultanées de la
chromatographie ont conduit à l'identification de plus de 70 pigments dans 45 patrons
pigmentaires (Jeffrey et al., 2013). Cela confère une puissance supplémentaire considérable à
l'analyse des pigments, mais complique aussi considérablement leur interprétation.
Relativement, peu de pigments sont aujourd'hui considérés comme des marqueurs univoques,
la plupart étant répartis entre plusieurs taxons.
Il est difficile de prédire avec précision la teneur en pigments d'une population sur le terrain,
même si l'on connaît les espèces présentes à cause de la variabilité du contenu pigmentaire en
fonction des facteurs environnementaux et au sein des espèces (mêmes genres ou souches de
la même espèce). Néanmoins, les pigments restent des marqueurs chimiotaxonomiques
précieux pour les taxons d'algues, en particulier pour le pico et le nanophytoplancton, qui sont
difficiles à identifier au microscope. La force de l'analyse des pigments réside dans
l'identification et la cartographie des populations au sein d'un ensemble de données, qu'il
s'agisse de régions dans le cadre d'une étude géographique ou d'une succession de populations
dans le cadre d'une étude temporelle.
Cette partie traite de l'interprétation des données pigmentaires sur le terrain, notamment du
statut des différents marqueurs pigmentaires et des outils disponibles pour leur interprétation
quantitative.
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