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Informatique médicale, e-Santé
Les données clinico-biologiques doivent être associées à des informations de
contexte indispensables à leur interprétation. Ces informations de contexte sont
de plusieurs types :
– les informations médico-légales concernant le contexte de création de la
données (comme, par exemple, l’auteur, le transcripteur ou le cas échéant
la personne ayant validé la donnée, leur rôle et responsabilité, l’institution
et service auxquels il appartient, la date de saisie, ou de contrôle ou de
réalisation, la version de la donnée, etc.) ;
– le contexte du processus de soins (comme, par exemple, un lien avec un
épisode de soins préexistant ou avec une étape dans un protocole de thérapeutique, etc.) ;
– le degré de fiabilité de la donnée (comme le degré de certitude d’un
diagnostic, les étapes du raisonnement médical qui ont permis de l’établir, des données issues de la littérature scientifique permettant d’étayer la
donnée, etc.).
Codage des éléments de données de santé
La langue naturelle (texte libre) est le moyen le plus répandu pour exprimer
des informations, or les systèmes d’informations peuvent difficilement exploiter
automatiquement les textes libres.
Cependant, l’information clinique non structurée (sous forme textuelle) peut
être annotée sémantiquement a posteriori en utilisant la (les) ressource(s)
terminologique(s) choisie(s) :
– soit manuellement : par exemple, le clinicien va coder le diagnostic d’un
patient, en s’appuyant sur les comptes rendus en texte libre du dossier et
en utilisant la CIM-10 ;
Tableau IV – Résultats d’un antibiogramme testant la sensibilité d’un Escherichia coli (E. coli) et
d’un Staphylococcus aureus (
s S. aureus) isolés lors d’un examen cytobactériologique des urines.
Antibiogramme
ISOLAT #1 (E. coli)
ISOLAT #1 (S. aureus)
Bêtalactamines
Ampicilline
> 16
Résistant
Cefalotine
<= 1
Intermédiaire
<= 2
Sensible
Quinolones
Ciprofloxacine
<= 0.5
Sensible
Ofloxacine
<= 2
Sensible
> 4
Résistant
Aminosides
Amikacine
<= 0.5
Sensible
Gentamicine
> 8 R
Résistant