Chapitre 2 : Matériel et méthodologie
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Ainsi, en portant sur un graphique Lm-L’ en fonction de L’, on obtient une régression linéaire à
partir de laquelle on peut estimer a et b et par conséquent L∞ et Z/K (Sparre et Venema, 1996).
En appliquant la méthode directement sur le programme informatique FISAT II (Gayanilo et al.,
2005), on peut estimer facilement ces deux paramètres L∞ et Z/K.
3.1.1.3. Méthode ELEFAN I (Pauly et David, 1981) : estimation de L∞ et K
Notre approche s'appuie sur l'analyse des structures de taille via ELEFAN 1 (Electronic Length
Frequency Analysis), un programme intégré dans le logiciel FISAT II (Gayanilo et al., 2005).
• Principe de fonctionnement du programme ELAFAN I
ELEFAN I est une méthode non paramétrique mise au point par Pauly et David (1981) et décrite
par Pauly (1987) dans Pauly et Moreau (1997). Elle permet d'estimer les paramètres de
croissance de poissons ou d'invertébrés à partir de données de taille récoltées à des dates
différentes. La méthode repose sur l'analyse des modes de taille observés dans les échantillons et
leur comparaison avec des modes théoriques calculés à partir de différents paramètres de
croissance, notamment la longueur asymptotique maximale (L∞) et le taux de croissance (K)
décrits par l'équation de von Bertalanffy (1934). Pour chaque combinaison de valeurs
exploratoires de L∞ et K, et pour chaque date d'échantillonnage, les modes théoriques
correspondant aux différents âges des individus sont calculés. Ensuite, on compare ces modes
théoriques aux modes observés dans l'échantillon. La technique consiste à identifier les valeurs
de L∞ et K qui maximisent le nombre de modes théoriques qui coïncident avec les modes
observés (Ladoul, 2011).
L'ajustement est évalué par un coefficient R, qui est le rapport entre le nombre de modes
expliqués (Explained Sum of Peaks, ESP) et le nombre total de modes observés (Available Sum
of Peaks, ASP). Ce coefficient est calculé selon la formule R = (ESP/ASP) * 1000.
L'ajustement optimal est celui qui présente le R le plus élevé (Sparre et Venema, 1996).
En résumé les principes de fonctionnement d'ELEFAN I sont : (Pauly et Morcau 1997)
- Tout d'abord constituer une base de données (distributions de fréquence de tailles datées, en un
seul ou plusieurs échantillons, éventuellement irréguliers et répartis sur une année ou
d'avantage).
- Restructuration des échantillons par le programme. Chaque fréquence observée est comparée à
la moyenne mobile pour identifier les maxima et les minima de la nouvelle distribution de
fréquences.
- Calcul de l'ASP, dont la valeur maximale correspondrait aux coordonnés du point de passage
de la courbe de croissance optimale à déterminer ultérieurement.
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Ainsi, en portant sur un graphique Lm-L’ en fonction de L’, on obtient une régression linéaire à
partir de laquelle on peut estimer a et b et par conséquent L∞ et Z/K (Sparre et Venema, 1996).
En appliquant la méthode directement sur le programme informatique FISAT II (Gayanilo et al.,
2005), on peut estimer facilement ces deux paramètres L∞ et Z/K.
3.1.1.3. Méthode ELEFAN I (Pauly et David, 1981) : estimation de L∞ et K
Notre approche s'appuie sur l'analyse des structures de taille via ELEFAN 1 (Electronic Length
Frequency Analysis), un programme intégré dans le logiciel FISAT II (Gayanilo et al., 2005).
• Principe de fonctionnement du programme ELAFAN I
ELEFAN I est une méthode non paramétrique mise au point par Pauly et David (1981) et décrite
par Pauly (1987) dans Pauly et Moreau (1997). Elle permet d'estimer les paramètres de
croissance de poissons ou d'invertébrés à partir de données de taille récoltées à des dates
différentes. La méthode repose sur l'analyse des modes de taille observés dans les échantillons et
leur comparaison avec des modes théoriques calculés à partir de différents paramètres de
croissance, notamment la longueur asymptotique maximale (L∞) et le taux de croissance (K)
décrits par l'équation de von Bertalanffy (1934). Pour chaque combinaison de valeurs
exploratoires de L∞ et K, et pour chaque date d'échantillonnage, les modes théoriques
correspondant aux différents âges des individus sont calculés. Ensuite, on compare ces modes
théoriques aux modes observés dans l'échantillon. La technique consiste à identifier les valeurs
de L∞ et K qui maximisent le nombre de modes théoriques qui coïncident avec les modes
observés (Ladoul, 2011).
L'ajustement est évalué par un coefficient R, qui est le rapport entre le nombre de modes
expliqués (Explained Sum of Peaks, ESP) et le nombre total de modes observés (Available Sum
of Peaks, ASP). Ce coefficient est calculé selon la formule R = (ESP/ASP) * 1000.
L'ajustement optimal est celui qui présente le R le plus élevé (Sparre et Venema, 1996).
En résumé les principes de fonctionnement d'ELEFAN I sont : (Pauly et Morcau 1997)
- Tout d'abord constituer une base de données (distributions de fréquence de tailles datées, en un
seul ou plusieurs échantillons, éventuellement irréguliers et répartis sur une année ou
d'avantage).
- Restructuration des échantillons par le programme. Chaque fréquence observée est comparée à
la moyenne mobile pour identifier les maxima et les minima de la nouvelle distribution de
fréquences.
- Calcul de l'ASP, dont la valeur maximale correspondrait aux coordonnés du point de passage
de la courbe de croissance optimale à déterminer ultérieurement.