Généralité
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Ils sont difficilement différentiables des autres streptocoques à l'examen direct (Hoen et al.,
2002). Leur génome présente un faible pourcentage en G+C, variant de 37,5 à 44 % (Flahaut
et al., 1997) .
Selon le Bergey’s, manuel de la bactériologie systématique (2009), le genre Enterococcus est
classé comme suit :
 Domaine : Bacteria ou Eubacteria
 Phylum : Firmicutes
 Classe : Bacilli
 Ordre : Lactobacillales
 Famille : Enterococcaceae
 Genre : Enterococcus
 Espèce : E. faecalis / E. faecium /E. avium / E. durans / E. gallinarum
Le genre Enterococcus comptait 37 espèces en 2011, 48 espèces en 2013 et 55 espèces en 2017
(Boussouar, 2017)
3. Habitat
Les entérocoques sont des bactéries ubiquistes (Delarras, 2007), leur habitat naturel
prédominant est le tractus intestinal des mammifères, y compris celui de l’homme
(Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium) mais on les trouve également plus rarement au
niveau du vagin ou de la cavité buccale (Beargie et al., 1975 ; Godreuil et al, 2007 ;
Schloissnig et al., 2013). Ils sont présents chez d'autres espèces animales, tels que les reptiles,
les oiseaux et les insectes. (Mundt et al., 1962 ; Deibel et al., 1963 ; Flahaut et al., 1997 ;
Gilmore et al., 2013)
Les entérocoques sont des bactéries présentes dans différentes niches écologiques, notamment
dans les eaux douces (Enterococcus haemoperoxidus, Enterococcus moraviensis) et marines
(Enterococcus aquimarinus). Ils peuvent également coloniser les végétaux, tels
qu’Enterococcus sulfureus. Certains entérocoques ont même été trouvés chez des espèces
animales préhistoriques, montrant leur capacité à s'adapter aux habitudes de vie au fil du temps.
En plus de cela, les entérocoques sont également présents dans différentes eaux (usées, douces
et de mer). (Manero et al., 1999).
La variation de la flore entérocoque chez les différents hôtes, qu'ils soient humains ou animaux,
constitue un aspect crucial de la compréhension de la dynamique microbienne intestinale. Dès
les premiers jours de vie, les entérocoques dominent souvent l'intestin, mais cette prédominance
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Caractérisation et évaluation de la virulence et de la résistance aux antibiotiques chez les entérocoques isolés dans le milieu marin - 17/154

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