Chapitre II
Matériel et méthodes
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2.3. Description des données d’entrées pour l’obtention des paramètres DEB
La procédure d'estimation des paramètres DEB requiert neuf données d'entrée appelées "à
variation nulle" (Zero variate data) qui sont dans le contexte de la modélisation DEB pour fournir
des informations sur les paramètres du modèle qui ne varient pas dans le temps ou dans les
conditions expérimentales. Ces données sont généralement des mesures de caractéristiques
statiques des organismes, telles que la taille, la masse, la composition corporelle, etc., qui sont
considérées comme constantes ou peu variables sur la période d'étude. Il nécessite aussi six
pseudo-données (selon le Tableau II.2), qui sont en réalité des valeurs standard préétablies pour
certains paramètres DEB, extraites de Kooijman (2010). Ces pseudo-données sont utilisées dans le
processus d'ajustement des paramètres pour éviter les problèmes de non-convergence. En utilisant
ces pseudo-données comme points de référence, on peut obtenir des estimations plus fiables et
stables des paramètres DEB, garantissant ainsi des résultats plus robustes et cohérents dans la
modélisation DEB. Il est important de sélectionner soigneusement les pseudo-données pour
qu'elles soient représentatives du système biologique étudié et pour s'assurer que les estimations
des paramètres DEB restent biologiquement plausibles.
Tableau II. 3. Description des données d’entrée du modèle DEB standard.
Type de données
Symbole
Description
Données à variation nulle
𝑎 𝑏
Age à la naissance
𝑎 𝑚
Longévité
𝐿 𝑏
Longueur à la naissance
𝐿 𝑝
Longueur de la première maturité sexuelle
𝐿 𝑖
Longueur maximale
𝑊 𝑤
𝑏
Poids à la naissance
𝑊 𝑤
𝑝
Poids à la puberté
𝑊 𝑤
𝑖
Poids maximal
𝑅 𝑖
Reproduction maximale
Pseudo données (paramètres
généralisés de l’animal)
𝑣̇
Conductance énergétique
κ
Fraction d’allocation au maintien somatique
κ 𝑅
Efficacité de la reproduction
[𝑝̇̇ 𝑀]
Volume spécifique à la maintenance somatique
κ 𝑗
Coefficient de taux de maintien de la maturité
κ 𝐺
Efficacité de la croissance
Données univariées
(t, Lt)
Clé âge-longueur
(LT, PT)
Relation taille-poids
Le modèle DEB (Dynamic Energy Budget) montre comment les paramètres du modèle de
croissance de von Bertalanffy, tels que la longueur ultime (𝐿𝑤,∞) et le coefficient de croissance de
von Bertalanffy (𝑟̇ 𝐵 ), dépendent des paramètres physiologiques fondamentaux, appelés
paramètres primaires du modèle DEB standard.