Chapitre 2
Matériel et méthodes
21
Par ailleurs, nous avons également mis en œuvre une autre méthode, celle préconisée par
Tessmer et al. (2014) qui permet de déterminer un indice à partir de la formule suivante :
S/(S + E) × 100, où S est le nombre des cellules à tanins par unité de surface et E le nombre
de cellules de parenchyme au niveau de la même surface. Par conséquent, nous avons
également dénombré le nombre de cellules parenchymateuses sur l’ensemble des coupes
effectuées.
2.4. Traitements statistiques
Les analyses statistiques ont été réalisées avec le package R Commander, une surcouche
dans l'environnement R4.1.2, open source (https://www.r-project.org/). Les tests statistiques
utilisés sont réalisés au seuil de signification de 95%.
Pour la comparaison de moyennes, nous avons utilisé le test t de Student et son extension
ANOVA à un facteur, dans le cas où nous avons plus de 2 groupes à comparer, et ce, lorsque
les données respectaient les conditions de mise en œuvre des tests paramétriques : normalité
des distributions des variables quantitatives, homogénéité des variances. Lorsque les
conditions d’application de ce test ne sont pas vérifiées, nous avons utilisé le test non
paramétrique U de Mann-Whitney et son extension le test de Kruskal-Wallis dans les cas
où il y a plus de 2 groupes à comparer. Lorsque des différences significatives sont identifiées,
nous avons utilisé un test post hoc de Tukey pour situer les différences entre stations. Pour
la comparaison des pourcentages nous avons utilisé le test non paramétrique du Khi-deux.
Enfin, nous avons utilisé la corrélation de Spearman pour évaluer : les relations entre la
densité et l’indice des cellules à tanins et la densité des cellules à tanins entre les 2 espèces.
Matériel et méthodes
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Par ailleurs, nous avons également mis en œuvre une autre méthode, celle préconisée par
Tessmer et al. (2014) qui permet de déterminer un indice à partir de la formule suivante :
S/(S + E) × 100, où S est le nombre des cellules à tanins par unité de surface et E le nombre
de cellules de parenchyme au niveau de la même surface. Par conséquent, nous avons
également dénombré le nombre de cellules parenchymateuses sur l’ensemble des coupes
effectuées.
2.4. Traitements statistiques
Les analyses statistiques ont été réalisées avec le package R Commander, une surcouche
dans l'environnement R4.1.2, open source (https://www.r-project.org/). Les tests statistiques
utilisés sont réalisés au seuil de signification de 95%.
Pour la comparaison de moyennes, nous avons utilisé le test t de Student et son extension
ANOVA à un facteur, dans le cas où nous avons plus de 2 groupes à comparer, et ce, lorsque
les données respectaient les conditions de mise en œuvre des tests paramétriques : normalité
des distributions des variables quantitatives, homogénéité des variances. Lorsque les
conditions d’application de ce test ne sont pas vérifiées, nous avons utilisé le test non
paramétrique U de Mann-Whitney et son extension le test de Kruskal-Wallis dans les cas
où il y a plus de 2 groupes à comparer. Lorsque des différences significatives sont identifiées,
nous avons utilisé un test post hoc de Tukey pour situer les différences entre stations. Pour
la comparaison des pourcentages nous avons utilisé le test non paramétrique du Khi-deux.
Enfin, nous avons utilisé la corrélation de Spearman pour évaluer : les relations entre la
densité et l’indice des cellules à tanins et la densité des cellules à tanins entre les 2 espèces.
