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L’AGROÉCOLOGIE : RECHERCHES POUR LA TRANSITION DES FILIÈRES ET DES TERRITOIRES
conditions du milieu (sol, climat, nutriments) et de proposer de nouveaux critères de
sélection. Par exemple, une façon d’améliorer la valorisation des protocoles de sélection
animale serait de prévoir le génotypage systématique de tous les animaux inclus dans
des expérimentations systèmes, avec un outil de génotypage commun, afin de regrouper
les données et d’identifier des marqueurs génétiques associés à une plus grande robustesse des troupeaux dans différentes conditions de milieu.
Les expérimentations systèmes contribuent à la recherche d’innovation. Cependant, la
conception de systèmes de culture incluant le levier génétique est encore aujourd’hui
rare et se révèle compliquée en raison notamment, mais pas uniquement, de la difficulté
d’articuler les niveaux d’organisation du génome à la communauté et de faire le lien entre
l’approche du système et des travaux ciblés sur une discipline.
En conclusion, les méthodes de sélection en génétique végétale comme en génétique animale bénéficient d’outils permettant un suivi fin de la diversité génétique qui doivent être
mis à profit pour la transition agroécologique. Le changement majeur impulsé par l’agroécologie est non plus de chercher l’individu idéal, mais le groupe idéal pour un contexte
de production donné. Cela conduit à une reconception des objectifs de sélection et des
schémas de sélection, au-delà de l’identification de nouveaux critères de sélection. Elle
doit se faire conjointement avec l’évolution des systèmes de culture ou d’élevage pour
mieux valoriser la diversité génétique. Il reste encore à mieux intégrer la question du
choix du génotype aux différentes échelles de l’exploitation à la filière.
●
Références bibliographiques
Alemu S.W., Calus M.P.L., Muir W.M., Peeters K., Vereijken A., Bijma P., 2016. Genomic prediction of
survival time in a population of brown laying hens showing cannibalistic behaviour. Gen. Select.
Evol., 48, 68.
Barot S., Allard V., Cantarel A., Enjalbert J., Gauffreteau A., Goldringer I., Lata J.-C., Le Roux X., Niboyet A.,
Porcher E., 2017. Designing mixtures of varieties for multifunctional agriculture with the help of
ecology. A review. Agron. Sustain. Dev., 37, 20.
Blanc F., Ollion E., Puillet L., Delaby L., Ingrand S., Tichit M., Friggens N.C., 2013. Évaluation quantitative de la robustesse des animaux et du troupeau : quels principes retenir ? Renc. Rech.
Ruminants, 20, 265-272.
Litrico I., Violle C., 2015. Diversity in plant breeding: a new conceptual framework. Trends Plant Sci.,
20, 604-613.
Louarn G., Faverjon L., 2018. A generic individual-based model to simulate morphogenesis, C-N acquisition and population dynamics in contrasting forage legumes. Ann. Bot., 121, 875-896.
Meilhac J., Durand J.L., Beguier V., Litrico I., 2019. Increasing the benefits of species diversity in multispecies temporary grasslands by increasing within-species diversity. Ann. Bot., 123, 891-900. DOI:
10.1093/aob/mcy227.
Meilhac J., Maire V., Deschamps L., Flajoulot S., Litrico I., (in press). Species differentiation in grassland canopy is mediated by selection and plasticity. Nature Plants.
L’AGROÉCOLOGIE : RECHERCHES POUR LA TRANSITION DES FILIÈRES ET DES TERRITOIRES
conditions du milieu (sol, climat, nutriments) et de proposer de nouveaux critères de
sélection. Par exemple, une façon d’améliorer la valorisation des protocoles de sélection
animale serait de prévoir le génotypage systématique de tous les animaux inclus dans
des expérimentations systèmes, avec un outil de génotypage commun, afin de regrouper
les données et d’identifier des marqueurs génétiques associés à une plus grande robustesse des troupeaux dans différentes conditions de milieu.
Les expérimentations systèmes contribuent à la recherche d’innovation. Cependant, la
conception de systèmes de culture incluant le levier génétique est encore aujourd’hui
rare et se révèle compliquée en raison notamment, mais pas uniquement, de la difficulté
d’articuler les niveaux d’organisation du génome à la communauté et de faire le lien entre
l’approche du système et des travaux ciblés sur une discipline.
En conclusion, les méthodes de sélection en génétique végétale comme en génétique animale bénéficient d’outils permettant un suivi fin de la diversité génétique qui doivent être
mis à profit pour la transition agroécologique. Le changement majeur impulsé par l’agroécologie est non plus de chercher l’individu idéal, mais le groupe idéal pour un contexte
de production donné. Cela conduit à une reconception des objectifs de sélection et des
schémas de sélection, au-delà de l’identification de nouveaux critères de sélection. Elle
doit se faire conjointement avec l’évolution des systèmes de culture ou d’élevage pour
mieux valoriser la diversité génétique. Il reste encore à mieux intégrer la question du
choix du génotype aux différentes échelles de l’exploitation à la filière.
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Références bibliographiques
Alemu S.W., Calus M.P.L., Muir W.M., Peeters K., Vereijken A., Bijma P., 2016. Genomic prediction of
survival time in a population of brown laying hens showing cannibalistic behaviour. Gen. Select.
Evol., 48, 68.
Barot S., Allard V., Cantarel A., Enjalbert J., Gauffreteau A., Goldringer I., Lata J.-C., Le Roux X., Niboyet A.,
Porcher E., 2017. Designing mixtures of varieties for multifunctional agriculture with the help of
ecology. A review. Agron. Sustain. Dev., 37, 20.
Blanc F., Ollion E., Puillet L., Delaby L., Ingrand S., Tichit M., Friggens N.C., 2013. Évaluation quantitative de la robustesse des animaux et du troupeau : quels principes retenir ? Renc. Rech.
Ruminants, 20, 265-272.
Litrico I., Violle C., 2015. Diversity in plant breeding: a new conceptual framework. Trends Plant Sci.,
20, 604-613.
Louarn G., Faverjon L., 2018. A generic individual-based model to simulate morphogenesis, C-N acquisition and population dynamics in contrasting forage legumes. Ann. Bot., 121, 875-896.
Meilhac J., Durand J.L., Beguier V., Litrico I., 2019. Increasing the benefits of species diversity in multispecies temporary grasslands by increasing within-species diversity. Ann. Bot., 123, 891-900. DOI:
10.1093/aob/mcy227.
Meilhac J., Maire V., Deschamps L., Flajoulot S., Litrico I., (in press). Species differentiation in grassland canopy is mediated by selection and plasticity. Nature Plants.