Polyols non cycliques
43
I
2.41 (,T2)
2.42 ('T,)
2.43
2.44
sent de la décrire avec les paramètres O,, et P. Cette description s'est imposée dans
la littérature cristallographique''1.
On expliquera cette notation sur un exemple tiré de la chimie des nucléosidesnucléotides. C'est de très loin la famille la plus importante de furanosides (voir le
paragraphe 3.4). Les nucléosides sont des combinaisons glycosidiques d'une base
hétérocyclique et d'un résidu p-D-ribofuranosyle ou 2-déoxy-0 -D-éqthro-pentofiiranosyle. L'exemple choisi est le nucléoside artificiel 5-iodoüridine. On observe deux conformations différentes de cette molécule dans le même cristal, voisines respectivement de 3T2 2.41 et 2T3 2.42. L'angle dièdre maximum est entre 2'
et 3'. Pour que P soit voisin de O, on choisira donc z2 = O,, (Fig. 2.10) et, par suite,
pour O , . . . O,, les valeurs z3, z ,
, zo, z,, respectivement. La connaissance de deux
angles dièdres permet de calculer z, , et P. L'angle P a le caractère d'une phase et
z ,
, est une mesure de l'applatissement du cycle. La conformation 2.41, P = 9", est
à mi-chemin entre 3T2 et 'E. On a z
, = 36" et l'angle dièdre maximum 35" entre
2' et 3'. La conformation 2.42, P = 175", est assez voisine de 2T3. L'angle dièdre
maximum est encore entre 2' et 3', - 41". Le fait qu'une même molécule puisse se
trouver sous deux conformations différentes dans le même cristal est en soi révélateur de leur faible différence d'énergie. C'est tout de même inhabituel et les
nucléosides-nucléotides se répartissent également entre 0 < P < 36" et
144 < P < 180" avec peu d'exceptions.
2.10 POLYOLS NON CYCLIQUES
Prenons comme exemple le galactitol à l'état solide, 2.43. La molécule a la
forme d'un zigzag plan. C'est la disposition favorite en solution, sauf si elle
conduit à des interactions éclipsées 1,3 des hydroxyles. Dans ce dernier cas, la
molécule se tord en forme de faucille. Cette conformation dérive du zigzag plan
par rotation de 120" autour d'une liaison C-C interne. On observe la conformation faucille sur le diéthyl dithioacétal du D-ribose peracétylé 2.44.
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2.41 (,T2)
2.42 ('T,)
2.43
2.44
sent de la décrire avec les paramètres O,, et P. Cette description s'est imposée dans
la littérature cristallographique''1.
On expliquera cette notation sur un exemple tiré de la chimie des nucléosidesnucléotides. C'est de très loin la famille la plus importante de furanosides (voir le
paragraphe 3.4). Les nucléosides sont des combinaisons glycosidiques d'une base
hétérocyclique et d'un résidu p-D-ribofuranosyle ou 2-déoxy-0 -D-éqthro-pentofiiranosyle. L'exemple choisi est le nucléoside artificiel 5-iodoüridine. On observe deux conformations différentes de cette molécule dans le même cristal, voisines respectivement de 3T2 2.41 et 2T3 2.42. L'angle dièdre maximum est entre 2'
et 3'. Pour que P soit voisin de O, on choisira donc z2 = O,, (Fig. 2.10) et, par suite,
pour O , . . . O,, les valeurs z3, z ,
, zo, z,, respectivement. La connaissance de deux
angles dièdres permet de calculer z, , et P. L'angle P a le caractère d'une phase et
z ,
, est une mesure de l'applatissement du cycle. La conformation 2.41, P = 9", est
à mi-chemin entre 3T2 et 'E. On a z
, = 36" et l'angle dièdre maximum 35" entre
2' et 3'. La conformation 2.42, P = 175", est assez voisine de 2T3. L'angle dièdre
maximum est encore entre 2' et 3', - 41". Le fait qu'une même molécule puisse se
trouver sous deux conformations différentes dans le même cristal est en soi révélateur de leur faible différence d'énergie. C'est tout de même inhabituel et les
nucléosides-nucléotides se répartissent également entre 0 < P < 36" et
144 < P < 180" avec peu d'exceptions.
2.10 POLYOLS NON CYCLIQUES
Prenons comme exemple le galactitol à l'état solide, 2.43. La molécule a la
forme d'un zigzag plan. C'est la disposition favorite en solution, sauf si elle
conduit à des interactions éclipsées 1,3 des hydroxyles. Dans ce dernier cas, la
molécule se tord en forme de faucille. Cette conformation dérive du zigzag plan
par rotation de 120" autour d'une liaison C-C interne. On observe la conformation faucille sur le diéthyl dithioacétal du D-ribose peracétylé 2.44.