CHAPITRE 14
Structure de quelques complexes
sucre-protéine cristallisés
14.1 GÉNÉRALITÉS. LE COMPLEXE ABP-L-ARABINOSE
14.1.1 Protéines et sucres
Nous rencontrons dans ce livre quatre types de protéines qui s’associent aux
sucres : les enzymes de métabolisme des sucres, les lectines, les anticorps spécifiques et les protéines de transport. On a pu cristalliser un nombre important de
ces protéines et les examiner aux rayons X pour déterminer leur structure tertiaire. Compte tenu de leur masse moléculaire élevée, l’analyse des spectres de diffraction est un travail difficile. Cependant, on est guidé par la connaissance de la
structure primaire, c’est-à-dire l’enchaînement peptidique, obtenue par les procédés chimiques. Le pouvoir de résolution des méthodes est en moyenne de 2,5 A.
I1 est meilleur dans les exemples que nous donnerons. La connaissance de la structure de la protéine ne donne que des présomptions sur celle du complexe, d’autant
plus qu’il peut y avoir des modifications de conformation à la complexation. On
a pu obtenir à l’état cristallisé certains complexes protéine-sucre et décrire leur
structure avec des degrés de résolution comparables. En général le site récepteur
sur la protéine est une cavité allongée, plus ou moins profonde, mais le reste de la
protéine semble éminemment variable suivant sa fonction biologique[’]. On
connaît et on a étudié des combinaisons cristallines appartenant aux quatre types
de protéines mentionnés ci-dessus. Dans le domaine des enzymes, mentionnons le
complexe entre le poly-N-acétylchitobiose et le lysozyme, enzyme capable d’hydrolyser les parois bactériennes, qui a six sites récepteurs, et entre une maltodextrine et la takaamylase, enzyme qui hydrolyse l’amylose et peut s’associer une
unité hexasaccharidique. Ces études ont une importance capitale pour l’élucidation du mécanisme de l’hydrolyse enzymatique. Cependant, comme il s’agit d’articles déjà anciens que le lecteur non cristallographe aura quelques difficultés à
jauger, nous préférons renvoyer aux commentaires qui en ont été faits”]. Cesprit
de ce chapitre est de décrire avec précision l’environnement immédiat du sucre et
c’est en fonction de ceci que nous avons choisi les exemples. Nous recommandons au lecteur d’examiner les vues stéréoscopiques et en couleur des mémoires
originaux.
Structure de quelques complexes
sucre-protéine cristallisés
14.1 GÉNÉRALITÉS. LE COMPLEXE ABP-L-ARABINOSE
14.1.1 Protéines et sucres
Nous rencontrons dans ce livre quatre types de protéines qui s’associent aux
sucres : les enzymes de métabolisme des sucres, les lectines, les anticorps spécifiques et les protéines de transport. On a pu cristalliser un nombre important de
ces protéines et les examiner aux rayons X pour déterminer leur structure tertiaire. Compte tenu de leur masse moléculaire élevée, l’analyse des spectres de diffraction est un travail difficile. Cependant, on est guidé par la connaissance de la
structure primaire, c’est-à-dire l’enchaînement peptidique, obtenue par les procédés chimiques. Le pouvoir de résolution des méthodes est en moyenne de 2,5 A.
I1 est meilleur dans les exemples que nous donnerons. La connaissance de la structure de la protéine ne donne que des présomptions sur celle du complexe, d’autant
plus qu’il peut y avoir des modifications de conformation à la complexation. On
a pu obtenir à l’état cristallisé certains complexes protéine-sucre et décrire leur
structure avec des degrés de résolution comparables. En général le site récepteur
sur la protéine est une cavité allongée, plus ou moins profonde, mais le reste de la
protéine semble éminemment variable suivant sa fonction biologique[’]. On
connaît et on a étudié des combinaisons cristallines appartenant aux quatre types
de protéines mentionnés ci-dessus. Dans le domaine des enzymes, mentionnons le
complexe entre le poly-N-acétylchitobiose et le lysozyme, enzyme capable d’hydrolyser les parois bactériennes, qui a six sites récepteurs, et entre une maltodextrine et la takaamylase, enzyme qui hydrolyse l’amylose et peut s’associer une
unité hexasaccharidique. Ces études ont une importance capitale pour l’élucidation du mécanisme de l’hydrolyse enzymatique. Cependant, comme il s’agit d’articles déjà anciens que le lecteur non cristallographe aura quelques difficultés à
jauger, nous préférons renvoyer aux commentaires qui en ont été faits”]. Cesprit
de ce chapitre est de décrire avec précision l’environnement immédiat du sucre et
c’est en fonction de ceci que nous avons choisi les exemples. Nous recommandons au lecteur d’examiner les vues stéréoscopiques et en couleur des mémoires
originaux.