Table des matières
XXVII
© Lavoisier
- La
photocopie non
autorisée est un
délit
1.2. Action du radical hydroxyle.....................................................................................179
1.2.1. Mécanismes de dégradation des bases...........................................................179
1.2.2. Mécanismes de dégradation du 2-désoxyribose..........................................180
2. Formation des dommages dans l’ADN cellulaire............................................................180
2.1. Nature et rendement de formation des lésions radio-induites............................... 180
2.2. Importance relative des effets directs et indirects..................................................182
2.3. Dommages de l’ADN induits par contamination.................................................... 182
3. Mécanismes de réparation des lésions de l’ADN............................................................ 182
3.1. Réparation des mésappariements..............................................................................183
3.2. Réparation des bases modifiées................................................................................184
3.2.1. Réversion des bases alkylées.........................................................................184
3.3. Réparation par excision de nucléotides (NER)......................................................... 184
3.4. Réparation par excision de bases (BER)................................................................... 185
3.4.1. Mécanisme général.......................................................................................... 185
3.4.2. Les protéines impliquées................................................................................187
3.5. Réparation des cassures de brin chez les eucaryotes..............................................190
3.5.1. Cassures simple brin......................................................................................190
3.5.2. Cassures double-brin......................................................................................190
Conclusions et perspectives..................................................................................................... 193
Références bibliographiques................................................................................................... 193
Chapitre 11
Biologie structurale des interactions entre protéines et éléments d’intérêt
(David Pignol, Catherine Berthomieu, Jean-Luc Pellequer, Olivier Pible,
Enrico Stura, Claude Vidaud)....................................................................................... 195
Introduction.............................................................................................................................. 195
1. Techniques de la biologie structurale appliquées aux interactions
métaux-protéine............................................................................................................. 196
1.1. Méthodes tridimensionnelles................................................................................... 196
1.1.1. La résonance magnétique nucléaire............................................................... 196
1.1.2. La biocristallographie....................................................................................196
1.2. Méthodes spectroscopiques.....................................................................................197
1.2.1. Les spectroscopies UV-visible et de fluorescence..........................................197
1.2.2. La spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier (IRTF)....................198
1.2.3. La spectrométrie de masse..............................................................................199
1.2.4. La spectroscopie dynamique de force........................................................... 199
1.3. Autres méthodes biophysiques................................................................................ 200
1.3.1. La microcalorimétrie..................................................................................... 200
1.3.2. Les techniques de résonance plasmonique de surface (SPR).....................201
1.4. Modélisation moléculaire........................................................................................ 202
2. Analyse de l’interaction métal-protéine : exemple de l'uranium...................................203
3. Les cibles moléculaires de toxicité.................................................................................. 203
3.1. Le blocage des sites fonctionnels dans les structures protéiques...........................203
3.2. Exemple de la transferrine...................................................................................... 206
4. Structure de quelques protéines impliquées dans les mécanismes
de détoxication.............................................................................................................. 206
4.1. Structure fonction des régulateurs senseurs de métaux......................................... 207
4.2. Chélation................................................................................................................... 207
XXVII
© Lavoisier
- La
photocopie non
autorisée est un
délit
1.2. Action du radical hydroxyle.....................................................................................179
1.2.1. Mécanismes de dégradation des bases...........................................................179
1.2.2. Mécanismes de dégradation du 2-désoxyribose..........................................180
2. Formation des dommages dans l’ADN cellulaire............................................................180
2.1. Nature et rendement de formation des lésions radio-induites............................... 180
2.2. Importance relative des effets directs et indirects..................................................182
2.3. Dommages de l’ADN induits par contamination.................................................... 182
3. Mécanismes de réparation des lésions de l’ADN............................................................ 182
3.1. Réparation des mésappariements..............................................................................183
3.2. Réparation des bases modifiées................................................................................184
3.2.1. Réversion des bases alkylées.........................................................................184
3.3. Réparation par excision de nucléotides (NER)......................................................... 184
3.4. Réparation par excision de bases (BER)................................................................... 185
3.4.1. Mécanisme général.......................................................................................... 185
3.4.2. Les protéines impliquées................................................................................187
3.5. Réparation des cassures de brin chez les eucaryotes..............................................190
3.5.1. Cassures simple brin......................................................................................190
3.5.2. Cassures double-brin......................................................................................190
Conclusions et perspectives..................................................................................................... 193
Références bibliographiques................................................................................................... 193
Chapitre 11
Biologie structurale des interactions entre protéines et éléments d’intérêt
(David Pignol, Catherine Berthomieu, Jean-Luc Pellequer, Olivier Pible,
Enrico Stura, Claude Vidaud)....................................................................................... 195
Introduction.............................................................................................................................. 195
1. Techniques de la biologie structurale appliquées aux interactions
métaux-protéine............................................................................................................. 196
1.1. Méthodes tridimensionnelles................................................................................... 196
1.1.1. La résonance magnétique nucléaire............................................................... 196
1.1.2. La biocristallographie....................................................................................196
1.2. Méthodes spectroscopiques.....................................................................................197
1.2.1. Les spectroscopies UV-visible et de fluorescence..........................................197
1.2.2. La spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier (IRTF)....................198
1.2.3. La spectrométrie de masse..............................................................................199
1.2.4. La spectroscopie dynamique de force........................................................... 199
1.3. Autres méthodes biophysiques................................................................................ 200
1.3.1. La microcalorimétrie..................................................................................... 200
1.3.2. Les techniques de résonance plasmonique de surface (SPR).....................201
1.4. Modélisation moléculaire........................................................................................ 202
2. Analyse de l’interaction métal-protéine : exemple de l'uranium...................................203
3. Les cibles moléculaires de toxicité.................................................................................. 203
3.1. Le blocage des sites fonctionnels dans les structures protéiques...........................203
3.2. Exemple de la transferrine...................................................................................... 206
4. Structure de quelques protéines impliquées dans les mécanismes
de détoxication.............................................................................................................. 206
4.1. Structure fonction des régulateurs senseurs de métaux......................................... 207
4.2. Chélation................................................................................................................... 207