hétérogène des groupes de ce dendrogramme. L’origine des souches y est variée, mais on
peut remarquer que 80 % des souches issues de l’eau à T0 figurent dans ce groupe. Cette
population est caractérisée par des valeurs d’indices synthétiques (tableau 2 bis) identiques à celles observées pour les échantillons issus de l’eau de mer naturelle (tableau 3). Le
grand nombre de phénons constitués d’un petit nombre de souches d’origines variées, ne
permet pas d’assimiler précisément chaque écotype à un grand groupe morpho
physiologique.
Phénon
Nombre
de souches
Origines
EAI
%
UAI
%
UAA
%
US
%
UOL
%
UOA
%
UAG
%
El
2
WD6, WD7
6
18
17
0
0
13
100
E2
6
TO
33
24
24
40
33
8
38
E3
4
WD5, WM7
0
22
33
9
17
3
69
E4
3
TO, WD5, WM7
26
36
47
20
44
33
58
E5
5
TO, WD4
9
25
27
45
40
0
35
E6
6
WD4, WD6, WD7, MU
30
28
42
40
17
6
38
E7
8
WD5, WD6, WD7
50
21
18
33
21
6
53
E8
12
WD5, WD6, WD7
13
35
13
77
25
7
79
E9
10
TO, WD4, WD5
26
32
13
66
63
3
73
E10
2
WD7, PR
22
29
33
6
0
25
88
E11
7
TO, WD4
17
33
26
50
57
16
57
E12
5
WDI9, WM7
27
32
22
33
27
43
65
E13
2
WD5, PR
II
5
4
6
0
0
0
EI4
6
TO, WD4
4
30
32
48
39
8
50
EI5
2
TO, PR
6
43
50
25
50
50
50
E16
4
WM7, MU
58
48
54
53
42
53
43
E17
4
TO, WD4, WD7
19
53
40
44
67
78
88
EI8
3
WD5, WD7, MU
33
54
50
46
56
71
58
E19
2
WD6, WD7
17
57
50
50
50
69
88
E20
6
TO, WM7
24
61
54
60
94
73
71
E21
2
WM7
56
71
75
50
100
69
88
E22
6
TO, WD4, WD5
24
31
19
52
28
13
46
E23
5
MU
24
35
40
45
13
30
50
E24
7
MU
32
55
61
57
67
63
43
E25
10
WD4, WD7, MU
42
19
8
34
13
25
33
E26
2
MU
II
II
4
0
0
13
50
E27
5
WDI9
29
10
5
30
7
8
0
E28
8
WD19, WM7
42
33
27
47
50
31
31
E29
2
TO
II
25
13
25
33
13
88
E30
2
TO
22
61
67
63
83
56
63
Population E globalement
27
33
28
44
38
25
53
Tableau 2 bis : TO : eau de remplissage, WD : prélèvement de l’eau d’élevage, le nombre suivant indique le
nombre de jours après le début de l’expérience, WM7 : prélèvement d’eau effectué au 7 e mois d’élevage, PR :
tractus digestif de la crevette, MU : cavité palléale d’une moule utilisée pour la nourriture, Vib : vibrioïdes,
Ent : entérobactéries, Pseud : pseudomonades, Mo-Ac : groupe des Moraxella-Acinetobacter, pour les
indices synthétiques voir le chapitre Matériel et Méthodes.
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peut remarquer que 80 % des souches issues de l’eau à T0 figurent dans ce groupe. Cette
population est caractérisée par des valeurs d’indices synthétiques (tableau 2 bis) identiques à celles observées pour les échantillons issus de l’eau de mer naturelle (tableau 3). Le
grand nombre de phénons constitués d’un petit nombre de souches d’origines variées, ne
permet pas d’assimiler précisément chaque écotype à un grand groupe morpho
physiologique.
Phénon
Nombre
de souches
Origines
EAI
%
UAI
%
UAA
%
US
%
UOL
%
UOA
%
UAG
%
El
2
WD6, WD7
6
18
17
0
0
13
100
E2
6
TO
33
24
24
40
33
8
38
E3
4
WD5, WM7
0
22
33
9
17
3
69
E4
3
TO, WD5, WM7
26
36
47
20
44
33
58
E5
5
TO, WD4
9
25
27
45
40
0
35
E6
6
WD4, WD6, WD7, MU
30
28
42
40
17
6
38
E7
8
WD5, WD6, WD7
50
21
18
33
21
6
53
E8
12
WD5, WD6, WD7
13
35
13
77
25
7
79
E9
10
TO, WD4, WD5
26
32
13
66
63
3
73
E10
2
WD7, PR
22
29
33
6
0
25
88
E11
7
TO, WD4
17
33
26
50
57
16
57
E12
5
WDI9, WM7
27
32
22
33
27
43
65
E13
2
WD5, PR
II
5
4
6
0
0
0
EI4
6
TO, WD4
4
30
32
48
39
8
50
EI5
2
TO, PR
6
43
50
25
50
50
50
E16
4
WM7, MU
58
48
54
53
42
53
43
E17
4
TO, WD4, WD7
19
53
40
44
67
78
88
EI8
3
WD5, WD7, MU
33
54
50
46
56
71
58
E19
2
WD6, WD7
17
57
50
50
50
69
88
E20
6
TO, WM7
24
61
54
60
94
73
71
E21
2
WM7
56
71
75
50
100
69
88
E22
6
TO, WD4, WD5
24
31
19
52
28
13
46
E23
5
MU
24
35
40
45
13
30
50
E24
7
MU
32
55
61
57
67
63
43
E25
10
WD4, WD7, MU
42
19
8
34
13
25
33
E26
2
MU
II
II
4
0
0
13
50
E27
5
WDI9
29
10
5
30
7
8
0
E28
8
WD19, WM7
42
33
27
47
50
31
31
E29
2
TO
II
25
13
25
33
13
88
E30
2
TO
22
61
67
63
83
56
63
Population E globalement
27
33
28
44
38
25
53
Tableau 2 bis : TO : eau de remplissage, WD : prélèvement de l’eau d’élevage, le nombre suivant indique le
nombre de jours après le début de l’expérience, WM7 : prélèvement d’eau effectué au 7 e mois d’élevage, PR :
tractus digestif de la crevette, MU : cavité palléale d’une moule utilisée pour la nourriture, Vib : vibrioïdes,
Ent : entérobactéries, Pseud : pseudomonades, Mo-Ac : groupe des Moraxella-Acinetobacter, pour les
indices synthétiques voir le chapitre Matériel et Méthodes.
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