GERBAM — Deuxième Colloque International de Bactériologie marine — CNRS, Brest, 1-5 octobre 1984
IFREMER, Actes de Colloques, 3, 1986, pp. 23-33
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ÉCHANTILLONNAGE DE VARIABLES BACTÉRIOLOGIQUES DANS LES MILIEUX AQUATIQUES
M. TROUSSELLIER*, B. BALEUX* ET P. ANDRÉ**
* Laboratoire d’Hydrobiologie, U.A.CNRS 694, Université des Sciences et Techniques du Languedoc, 34060 MONTPELLIER (FRANCE)
** Ecole Polytechnique, CP 6079, Succursale A, MONTREAL, H3C 3A7 (CANADA)
RÉSUMÉ - A partir d’échantillons d’eau provenant de différents niveaux d’observation d’une lagune saumâtre,
des solutions statistiques sont proposées pour l’optimisation de l’échantillonnage des abondances en bactéries
revivifiables. La variabilité entre les dénombrements est étudiée au moyen de la loi des puissances de Taylor.
L’optimisation des plans d’échantillonnage comprenant plusieurs sources de variabilité est réalisée par l’analyse
de variance hiérarchisée et par l’estimation des coûts d’échantillonnage de chacune des sources. Cette procédure
d’optimisation amène à un accroissement important de l’efficacité relative du plan d’échantillonnage et permet
de distinguer des différences significatives entre les concentrations bactériennes. L’effet de la réduction de
l’effort d’échantillonnage total sur la précision de ces concentrations moyennes met en évidence l’intérêt
scientifique et économique d’un choix a priori du niveau de précision approprié aux études.
Mots clés : bactéries, écosystèmes aquatiques, stratégies d’échantillonnage, analyse de variance, précision/coût.
ABSTRACT - Using water samples from several observation levels of a brackish lagoon, statistical solutions are
offered for the sampling optimisation of bacteria viable counts. The variability between plates count is studied
by the mean of the Taylor’s power law. The sampling strategy optimisation, including several sources of
variability, is realized by the way of hierarchical analysis of variance and the estimation of the sampling cost of
each source. This optimisation procedure result in a great increase of the relative efficiency of the sampling
design and allow to obtain significant differences between the bacterial concentrations. The effect of the
reduction of the total sampling effort on the precision of these average concentrations pointed out the scientific
and economic interest to choose a priori the suitable level of precision to the studies.
Key words : bacteria, aquatic ecosystems, sampling strategy, analysis of variance, precision/cost.
INTRODUCTION
Souvent ignorées, quelquefois évoquées, rarement prises en compte, les questions
d’échantillonnage sont cependant d’une grande importance lors de l’étude des variables
bactériologiques dans les milieux aquatiques (Maul et al., Hugues et al., 1983).
La plupart des hypothèses de travail en écologie bactérienne sont basées sur le recueil, la
description et l’analyse de paramètres bactériologiques pour une échelle d’espace et/ ou de
temps caractéristique de la problématique initiale. Ces objectifs ne peuvent être valablement atteints que dans la mesure où la variabilité étrangère au niveau d’observation choisi
est prise en compte et/ ou maîtrisée.
Le premier problème, commun à toutes les disciplines biologiques, mais très amplifié en
bactériologie, est l’étendue et la diversité des échelles d’observations existant dans les
milieux aquatiques. Pour relativiser notre perception du “monde bactérien” un parallé23
IFREMER, Actes de Colloques, 3, 1986, pp. 23-33
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ÉCHANTILLONNAGE DE VARIABLES BACTÉRIOLOGIQUES DANS LES MILIEUX AQUATIQUES
M. TROUSSELLIER*, B. BALEUX* ET P. ANDRÉ**
* Laboratoire d’Hydrobiologie, U.A.CNRS 694, Université des Sciences et Techniques du Languedoc, 34060 MONTPELLIER (FRANCE)
** Ecole Polytechnique, CP 6079, Succursale A, MONTREAL, H3C 3A7 (CANADA)
RÉSUMÉ - A partir d’échantillons d’eau provenant de différents niveaux d’observation d’une lagune saumâtre,
des solutions statistiques sont proposées pour l’optimisation de l’échantillonnage des abondances en bactéries
revivifiables. La variabilité entre les dénombrements est étudiée au moyen de la loi des puissances de Taylor.
L’optimisation des plans d’échantillonnage comprenant plusieurs sources de variabilité est réalisée par l’analyse
de variance hiérarchisée et par l’estimation des coûts d’échantillonnage de chacune des sources. Cette procédure
d’optimisation amène à un accroissement important de l’efficacité relative du plan d’échantillonnage et permet
de distinguer des différences significatives entre les concentrations bactériennes. L’effet de la réduction de
l’effort d’échantillonnage total sur la précision de ces concentrations moyennes met en évidence l’intérêt
scientifique et économique d’un choix a priori du niveau de précision approprié aux études.
Mots clés : bactéries, écosystèmes aquatiques, stratégies d’échantillonnage, analyse de variance, précision/coût.
ABSTRACT - Using water samples from several observation levels of a brackish lagoon, statistical solutions are
offered for the sampling optimisation of bacteria viable counts. The variability between plates count is studied
by the mean of the Taylor’s power law. The sampling strategy optimisation, including several sources of
variability, is realized by the way of hierarchical analysis of variance and the estimation of the sampling cost of
each source. This optimisation procedure result in a great increase of the relative efficiency of the sampling
design and allow to obtain significant differences between the bacterial concentrations. The effect of the
reduction of the total sampling effort on the precision of these average concentrations pointed out the scientific
and economic interest to choose a priori the suitable level of precision to the studies.
Key words : bacteria, aquatic ecosystems, sampling strategy, analysis of variance, precision/cost.
INTRODUCTION
Souvent ignorées, quelquefois évoquées, rarement prises en compte, les questions
d’échantillonnage sont cependant d’une grande importance lors de l’étude des variables
bactériologiques dans les milieux aquatiques (Maul et al., Hugues et al., 1983).
La plupart des hypothèses de travail en écologie bactérienne sont basées sur le recueil, la
description et l’analyse de paramètres bactériologiques pour une échelle d’espace et/ ou de
temps caractéristique de la problématique initiale. Ces objectifs ne peuvent être valablement atteints que dans la mesure où la variabilité étrangère au niveau d’observation choisi
est prise en compte et/ ou maîtrisée.
Le premier problème, commun à toutes les disciplines biologiques, mais très amplifié en
bactériologie, est l’étendue et la diversité des échelles d’observations existant dans les
milieux aquatiques. Pour relativiser notre perception du “monde bactérien” un parallé23