Milieux de culture :
Les effectifs bactériens et les structures des communautés bactériennes ont été déterminés
sur milieu de Oppenheimer et Zobell 2216E (1952). L’ammonification des acides est
étudiée sur un milieu spécialement préparé à cet effet de composition suivante :
Biotrypcase 2 g, K 2 HPO 4 0.3 g, Bleu de Bromothymol 0.03 g, Cysteine 0.5 g, D.Alphaalanine 0.5 g, Alpha-proline 0.5 g, Asparagine 0.5 g, Glutamate 0.5 g, Aspartate 0.5 g,
Alpha-arginine 0.5 g, Leucine 0.5 g, Glyrine 0.5 g, Alpha-lysine 0.5 g, L.méthiomie 0.5 g,
Agar 15 g, 11 d’eau de mer artificielle. pH ajusté à 7.5 avant stérilisation.
L’ammonification des acides aminés provoque une alcalinisation qui se traduit par un
virage du bleu de bromothymol au bleu intense.
La précipitation du carbonate a été recherchée sur 880 souches sur un milieu de culture
spécialement préparé à cet effet, de composition suivante :
Peptone 1 g, Extrait de levure 1 g, Acétate de Ca 2 g, KNO 3 0.5 gagar 15 g, 11 d’eau de mer
artificielle, pH ajusté à 7,5 avant stérilisation,
L’acétate de calcium est utilisé comme source organique de calcium comme Adolphe et
Billy (1974), Billy et Blanc (1977) et Novitsky (1981) le préconisent. La précipitation se
traduit par une apparition de dépôts de carbonate de calcium à la périphérie et sur la
colonie.
Analyse factorielle des correspondances
L’analyse factorielle des correspondances proposée dans les années 60 par J. P. Benzecri et
B. Escoffier, est devenue la méthode privilégiée de description des données qualitatives en
écologie (Laurec, 1979). Pour mettre en évidence des relations entre certains caractères
des populations bactériennes et les conditions d’incubation ou d’amendement nous avons
utilisé l’analyse factorielle des correspondances.
RÉSULTATS ET DISCUSSION :
Le grand nombre de souches étudiées (880) permet d’effectuer une étude statistique de la
répartition de celles précipitant le carbonate, et/ou ammonifiant les acides aminés, en
fonction des différentes conditions d’incubation. L’étude de cette répartition a pour but la
mise en évidence de l’existence, ou de la non existence d’un lien entre les deux processus de
précipitation du carbonate et d’ammonification des acides aminés, ainsi que de préciser
les conditions les plus favorable à l’instauration d’une microflore capable de précipiter le
carbonate.
Les conditions de culture imposées déterminent la configuration de la structure qui réunit
9 cas (fig. 2) identifiés par :
- (TOO) population de la carotte 1, au temps 0, établissant l’état initial - (SAN) population en présence de protéines en anaérobiose au bout de 1 mois - (SAE) population en
présence de protéines en aérobiose au bout de 1 mois - (1 AN) population en absence de
protéines en anaérobiose au bout de 1 mois - ( 1AE) population en absence de protéines en
aérobiose au bout de 1 mois - (3 AN) population en anaérobiose au bout de 3 mois - (3 AE)
population en aérobiose au bout de 3 mois - (6AN) population au bout de 6 mois en
anaérobiose - (6AE) population au bout de 6 mois en aérobiose
L’analyse factorielle a été faite en distinguant : - les souches qui précipitent le carbonate
sans ammonifier les acides aminés (OC), - celles qui ammonifient les acides aminés sans
précipiter le carbonate (BO), - celles qui réalisent les deux processus (BC), - celles qui ne
font aucun des deux (OO).
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Les effectifs bactériens et les structures des communautés bactériennes ont été déterminés
sur milieu de Oppenheimer et Zobell 2216E (1952). L’ammonification des acides est
étudiée sur un milieu spécialement préparé à cet effet de composition suivante :
Biotrypcase 2 g, K 2 HPO 4 0.3 g, Bleu de Bromothymol 0.03 g, Cysteine 0.5 g, D.Alphaalanine 0.5 g, Alpha-proline 0.5 g, Asparagine 0.5 g, Glutamate 0.5 g, Aspartate 0.5 g,
Alpha-arginine 0.5 g, Leucine 0.5 g, Glyrine 0.5 g, Alpha-lysine 0.5 g, L.méthiomie 0.5 g,
Agar 15 g, 11 d’eau de mer artificielle. pH ajusté à 7.5 avant stérilisation.
L’ammonification des acides aminés provoque une alcalinisation qui se traduit par un
virage du bleu de bromothymol au bleu intense.
La précipitation du carbonate a été recherchée sur 880 souches sur un milieu de culture
spécialement préparé à cet effet, de composition suivante :
Peptone 1 g, Extrait de levure 1 g, Acétate de Ca 2 g, KNO 3 0.5 gagar 15 g, 11 d’eau de mer
artificielle, pH ajusté à 7,5 avant stérilisation,
L’acétate de calcium est utilisé comme source organique de calcium comme Adolphe et
Billy (1974), Billy et Blanc (1977) et Novitsky (1981) le préconisent. La précipitation se
traduit par une apparition de dépôts de carbonate de calcium à la périphérie et sur la
colonie.
Analyse factorielle des correspondances
L’analyse factorielle des correspondances proposée dans les années 60 par J. P. Benzecri et
B. Escoffier, est devenue la méthode privilégiée de description des données qualitatives en
écologie (Laurec, 1979). Pour mettre en évidence des relations entre certains caractères
des populations bactériennes et les conditions d’incubation ou d’amendement nous avons
utilisé l’analyse factorielle des correspondances.
RÉSULTATS ET DISCUSSION :
Le grand nombre de souches étudiées (880) permet d’effectuer une étude statistique de la
répartition de celles précipitant le carbonate, et/ou ammonifiant les acides aminés, en
fonction des différentes conditions d’incubation. L’étude de cette répartition a pour but la
mise en évidence de l’existence, ou de la non existence d’un lien entre les deux processus de
précipitation du carbonate et d’ammonification des acides aminés, ainsi que de préciser
les conditions les plus favorable à l’instauration d’une microflore capable de précipiter le
carbonate.
Les conditions de culture imposées déterminent la configuration de la structure qui réunit
9 cas (fig. 2) identifiés par :
- (TOO) population de la carotte 1, au temps 0, établissant l’état initial - (SAN) population en présence de protéines en anaérobiose au bout de 1 mois - (SAE) population en
présence de protéines en aérobiose au bout de 1 mois - (1 AN) population en absence de
protéines en anaérobiose au bout de 1 mois - ( 1AE) population en absence de protéines en
aérobiose au bout de 1 mois - (3 AN) population en anaérobiose au bout de 3 mois - (3 AE)
population en aérobiose au bout de 3 mois - (6AN) population au bout de 6 mois en
anaérobiose - (6AE) population au bout de 6 mois en aérobiose
L’analyse factorielle a été faite en distinguant : - les souches qui précipitent le carbonate
sans ammonifier les acides aminés (OC), - celles qui ammonifient les acides aminés sans
précipiter le carbonate (BO), - celles qui réalisent les deux processus (BC), - celles qui ne
font aucun des deux (OO).
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