Chapitre I : Généralités et Méthodes d’étude
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Pour le calcul de ∆+ à partir des données d’abondance, les xi sont considérés comme équivaut à
l’unité (pour les espèces qui sont présentes) (CLARKE et WARWICK, 1998a).
Les valeurs de ∆+ sont utilisées pour effectuer le test de l’ « entonnoir » (« funnel »).
- Test du « funnel »
Afin de détecter des assemblages dont la diversité taxonomique serait influencée par des
perturbations, WARWICK et CLARKE (1998b) ont proposé le test de l’« entonnoir » ou du
« funnel ».
Le test de l’entonnoir consiste à comparer la variété taxonomique d’un site à la zone dont il
appartient.
A partir de la liste globale des S espèces connues de la zone considérée (bassin algérien), 1000
tirages aléatoires de taille m espèces sont réalisés (WARWICK et CLARKE 1998b). Des valeurs
∆m
+ sont calculées pour chaque tirage avec la détermination de l’intervalle de confiance à 95%
correspondant à chaque valeur (CLARKE et WARWICK, 1999). Il s’avère que les valeurs de ∆m
+
calculées sur la liste globale des espèces restent constantes pour tout m espèces, pendant que
l’intervalle de confiance à 95 % diminue (MERIGOT, 2008). Le graphique tracé de ∆m
+ en fonction
de m espèces avec l’intervalle de confiance à 95 % prend la forme d’un entonnoir « funnel ». Les
valeurs de ∆+ des différents sites (les trois régions : Ouest, Centre et Est) sont ensuite comparées à
la valeur moyenne ∆m+ et son intervalle de confiance. Cela permet de tester si le site en question a
une variété taxonomique d’espèces comparable à celle attendue dans la zone, ou alternativement
plus grande ou plus faible (WARWICK et CLARKE, 1998b).
2.2.3.2. Analyse des indices de répartition
Pour le peuplement d’une région considérée, nous avons considéré pour chacune des espèces de
rang i sa fréquence relative (Fr), densité (Dn) et sa biomasse (Dw).
Afin de mettre en évidence les espèces les plus caractéristiques, tous les indices ont été soumis à
deux types d’analyse multidimensionnelle : l’analyse en composantes principales (ACP) et la
classification ascendante hiérarchique (CAH).
Analyse en composantes principales ACP
Au total trois ACP ont été appliquées sur trois matrices de données centrées-réduites (variables
initiales de différentes grandeurs). La matrice de la région Ouest est composée de trois variables en
colonnes mesurées sur 89 espèces benthiques disposées en lignes. La région Centre compte 72
espèces benthiques sur lesquelles 3 variables ont été mesurées. Et enfin, la matrice de la région Est
est constituée de 3 colonnes (variables) et 80 lignes (espèces). Chaque espèce est désignée par un
code de cinq lettres (tab. 1, annexe II).
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Pour le calcul de ∆+ à partir des données d’abondance, les xi sont considérés comme équivaut à
l’unité (pour les espèces qui sont présentes) (CLARKE et WARWICK, 1998a).
Les valeurs de ∆+ sont utilisées pour effectuer le test de l’ « entonnoir » (« funnel »).
- Test du « funnel »
Afin de détecter des assemblages dont la diversité taxonomique serait influencée par des
perturbations, WARWICK et CLARKE (1998b) ont proposé le test de l’« entonnoir » ou du
« funnel ».
Le test de l’entonnoir consiste à comparer la variété taxonomique d’un site à la zone dont il
appartient.
A partir de la liste globale des S espèces connues de la zone considérée (bassin algérien), 1000
tirages aléatoires de taille m espèces sont réalisés (WARWICK et CLARKE 1998b). Des valeurs
∆m
+ sont calculées pour chaque tirage avec la détermination de l’intervalle de confiance à 95%
correspondant à chaque valeur (CLARKE et WARWICK, 1999). Il s’avère que les valeurs de ∆m
+
calculées sur la liste globale des espèces restent constantes pour tout m espèces, pendant que
l’intervalle de confiance à 95 % diminue (MERIGOT, 2008). Le graphique tracé de ∆m
+ en fonction
de m espèces avec l’intervalle de confiance à 95 % prend la forme d’un entonnoir « funnel ». Les
valeurs de ∆+ des différents sites (les trois régions : Ouest, Centre et Est) sont ensuite comparées à
la valeur moyenne ∆m+ et son intervalle de confiance. Cela permet de tester si le site en question a
une variété taxonomique d’espèces comparable à celle attendue dans la zone, ou alternativement
plus grande ou plus faible (WARWICK et CLARKE, 1998b).
2.2.3.2. Analyse des indices de répartition
Pour le peuplement d’une région considérée, nous avons considéré pour chacune des espèces de
rang i sa fréquence relative (Fr), densité (Dn) et sa biomasse (Dw).
Afin de mettre en évidence les espèces les plus caractéristiques, tous les indices ont été soumis à
deux types d’analyse multidimensionnelle : l’analyse en composantes principales (ACP) et la
classification ascendante hiérarchique (CAH).
Analyse en composantes principales ACP
Au total trois ACP ont été appliquées sur trois matrices de données centrées-réduites (variables
initiales de différentes grandeurs). La matrice de la région Ouest est composée de trois variables en
colonnes mesurées sur 89 espèces benthiques disposées en lignes. La région Centre compte 72
espèces benthiques sur lesquelles 3 variables ont été mesurées. Et enfin, la matrice de la région Est
est constituée de 3 colonnes (variables) et 80 lignes (espèces). Chaque espèce est désignée par un
code de cinq lettres (tab. 1, annexe II).