Généralités
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II. Notion de Taxonomie ou Taxinomie
La taxinomie ou taxonomie est la science qui a pour objet de décrire les organismes vivants et
de les regrouper en entités appelées taxons, afin de pouvoir les identifier puis les nommer et
les classer .Cette classification se fait sous forme d’un arbre, depuis une racine incluant tous
les êtres vivants existants ou ayant existé, jusqu’aux individus. Chaque nœud de l’arbre définit
un taxon, qui groupe tous les sous taxons qu’engendre le nœud.
Le mot taxonomie désigne donc au départ une méthode permettant de retrouver facilement
des individus après les avoir classés. Faire de la taxonomie, c’est donc mettre de l’ordre dans
la diversité du vivant.
La taxonomie permet l’obtention de :
-L’inventaire de la biodiversité.
-Les indicateurs biologiques des changements (exemple : réchauffement de la planète) ;
-Les identités et actions et /ou contrôle des espèces invasives.
II.1. Différences entre taxonomie et systématique (Gausse, 2000) :
Dans la plupart des disciplines des sciences de la vie, le terme taxonomie est inséparable de
celui de systématique, science qui a pour objet de dénombrer et de classer les taxons dans un
certain ordre, basé sur des principes divers.
Dans la pratique, le terme « systématique » désigne aussi bien la méthode utilisée (on dira par
exemple la « systématique phylogénétique ») que le résultat obtenu avec cette méthode (la «
systématique des Agaricales »). Dans le sens concret de résultat, les deux sciences sont peu
distinctes et souvent confondues, car pratiquées simultanément par les mêmes personnes. Les
taxinomistes ont de tout temps été nommés systématiciens, car après avoir étudié et décrit des
organismes, ils ont tout naturellement essayé de les classer à partir du bas niveau des espèces
(alpha taxonomy ou « taxinomie primaire »). Ceux qui utilisent surtout le sens de méthode, les
phylogénéticiens notamment, nomment souvent le résultat classification ou encore
«Taxonomie».
II.2. Le rangement ou le classement :
Définie par deux noms latins (Genre, espèce), l’espèce est devenue progressivement une
notion typologique fondamentale reposant non seulement sur des critères de ressemblances
mais également sur des critères d’interfécondité entre individus. L’espèce se reconnait à trois
couples de critères : morphologie et physiologie, écologie et distribution, fécondité intérieure
et stérilité extérieure (Grasse, 2000).
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