CHAPITRE 2 : MÉTHODES D’ÉTUDE
12
LDM : longueur de la partie molle de la nageoire dorsale.
HDM : hauteur de la partie molle de la nageoire dorsale.
HPC : hauteur de pédoncule caudal.
DIO : distance inter orbitaire, c'est la distance qui sépare les deux yeux.
DSO : distance entre le bord inférieur de l’œil et la base de la tête.
DPO : distance entre le bord antérieur de l’œil et l’extrémité du museau.
PCL1 : longueur supérieure du pédoncule caudale.
PCL2 : longueur inférieure du pédoncule caudale.
PcD : longueur entre la nageoire pectorale et la nageoire dorsale.
PcAn : longueur entre la nageoire pectorale et la nageoire anale
PcPv : longueur entre la nageoire pectorale et la nageoire pelvienne
Psto : distance séparant le bord postérieur de l’œil du point supérieure de l’opercule.
Pop : distance entre l’opercule et le pré-opercule
DL : longueur entre l’extrémité de la nageoire dorsale et la ligne latérale.
DA : longueur entre la ligne latérale et l’extrémité de la nageoire anale.
Une Analyse en Composantes Principales (ACP) a été réalisée sur ces données. L'ACP est une
technique qui permet de réduire un système complexe de corrélations en un plus petit nombre de
dimensions. C’est une méthode statistique essentiellement descriptive, son objectif est de
présenter, sous une forme graphique, le maximum de l’information contenue dans un tableau de
données (Philipeau, 1986). Elle permet donc d'établir un diagramme de dispersion unique dans
lequel apparaissent à la fois, chacune des variables considérées et chacun des objets observés
(Dagnelie, 1975 in Boufersaoui, 2012).
Elle est également appelée méthode des axes principaux : la recherche des composantes principales
consiste à déterminer ce qu’on pourrait considérer comme les longueurs ou variance (valeurs
propres) et les directions (vecteurs propres) des axes principaux. Pour 3 variables les 3 axes
principaux de l’ellipsoïde (qui peut être schématisé par un poisson) sont perpendiculaires et
représentent les 3 composantes, qui sont indépendantes. Il est clair que la première composante
explique la plus grande partie du système, la variance expliquée par les 2 autres composantes sera
moindre. Pour plus de 3 variables on parle d’hyperplan. On définit ainsi deux espaces : celui des
individus et celui des caractères, chaque individu ayant p coordonnés, est considéré comme un
vecteur d’un espace à p dimensions chaque variable sera une liste de n valeurs numériques
12
LDM : longueur de la partie molle de la nageoire dorsale.
HDM : hauteur de la partie molle de la nageoire dorsale.
HPC : hauteur de pédoncule caudal.
DIO : distance inter orbitaire, c'est la distance qui sépare les deux yeux.
DSO : distance entre le bord inférieur de l’œil et la base de la tête.
DPO : distance entre le bord antérieur de l’œil et l’extrémité du museau.
PCL1 : longueur supérieure du pédoncule caudale.
PCL2 : longueur inférieure du pédoncule caudale.
PcD : longueur entre la nageoire pectorale et la nageoire dorsale.
PcAn : longueur entre la nageoire pectorale et la nageoire anale
PcPv : longueur entre la nageoire pectorale et la nageoire pelvienne
Psto : distance séparant le bord postérieur de l’œil du point supérieure de l’opercule.
Pop : distance entre l’opercule et le pré-opercule
DL : longueur entre l’extrémité de la nageoire dorsale et la ligne latérale.
DA : longueur entre la ligne latérale et l’extrémité de la nageoire anale.
Une Analyse en Composantes Principales (ACP) a été réalisée sur ces données. L'ACP est une
technique qui permet de réduire un système complexe de corrélations en un plus petit nombre de
dimensions. C’est une méthode statistique essentiellement descriptive, son objectif est de
présenter, sous une forme graphique, le maximum de l’information contenue dans un tableau de
données (Philipeau, 1986). Elle permet donc d'établir un diagramme de dispersion unique dans
lequel apparaissent à la fois, chacune des variables considérées et chacun des objets observés
(Dagnelie, 1975 in Boufersaoui, 2012).
Elle est également appelée méthode des axes principaux : la recherche des composantes principales
consiste à déterminer ce qu’on pourrait considérer comme les longueurs ou variance (valeurs
propres) et les directions (vecteurs propres) des axes principaux. Pour 3 variables les 3 axes
principaux de l’ellipsoïde (qui peut être schématisé par un poisson) sont perpendiculaires et
représentent les 3 composantes, qui sont indépendantes. Il est clair que la première composante
explique la plus grande partie du système, la variance expliquée par les 2 autres composantes sera
moindre. Pour plus de 3 variables on parle d’hyperplan. On définit ainsi deux espaces : celui des
individus et celui des caractères, chaque individu ayant p coordonnés, est considéré comme un
vecteur d’un espace à p dimensions chaque variable sera une liste de n valeurs numériques