Généralités
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Selon SVEC et DEVRIESE, (2009), le genre Enterococcus est classé comme
suit : (AGUILAR-GALVEZ et al., 2012 ) :
 Domaine : Bacteria ou Eubacteria.
 Phylum : Firmicutes.
 Classe : Bacilli.
 Ordre : Lactobacillales.
 Famille : Enterococcaceae.
 Genre : Enterococcus.
De point de vue phylogénétiques, les entérocoques appartiennent à la branche clostridiale des
bactéries Gram positifs, avec un taux (G+C%) inférieur à 55%. (AGUILAR-GALVEZ et al.,
2012).
MONSTEIN et al., (1998), ont proposé de subdiviser le genre Enterococcus en groupes
d’espèces. En 2011, 35 espèces ont été déterminées sur la base d’ARNr 16S.(AGUILARGALVEZ et al., 2012). Et en 2016 le genre Enterococcus comprend 54 espèces. (DENIS F.et
al., 2016).Les groupes d’entérocoques suivants sont recensés à la base de séquançage des
gènes d’ARNr 16S : (SEPPO SALMINEN et al., 2004).
A. Le groupe E. faecium.
B. Le groupe E. avium.
C. Le groupe E. gallinarum.
D. Le groupe E. dispar.
E. Le groupe E. saccharolyticus.
F. Le groupe E. cecorum.
G. Le groupe E. faecalis.
Quelques espèces appartenant au genre Enterococcus ont été reclassées. Ainsi, E. porcinus a
été reclassé comme E. villorum (DE GRAEF et al., 2003) ; E. flavesceus comme E.
casseliflavus et E. saccharominuis comme E. Italicus (NASER et al., 2006). Par ailleurs,
quelques bactéries ont changé de genre E. seriolicida a été classé comme Lactococcus
garvieae (ELDAR et al., 1996), alors que E. solitarius est devenu Tetragenococcus
solitarius. (ENNAHAR et al., 2005).