Chapitre IV : résultats et discussion
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Tableau Ⅳ.2. Identification des séquences appartenant aux souches bactériennes choisis
A l’exception de trois bactéries, la majorité des bactéries testées appartiennent aux
Protéobactéries qui est un phylum majeur regroupant des bactéries à Gram-négatives. Nos
résultats sont compatibles avec les recherches précédentes qui ont trouvées que les
protéobactéries constituent le phylum le plus abondant dans plusieurs environnements,
notamment le sol (Spain et al., 2009), les sédiments (Mason et al., 2014) et l'eau de mer (Feng et
al., 2009). En outre, les protéobactéries se sont avérées être le phylum dominant dans les sites
contaminés par des hydrocarbures pétroliers (Zhang et al., 2010 ; Mukherjee et al., 2014). La
dominance de ce phylum peut être due à leur membrane lipopolysaccharide qui peut jouer le rôle
de biosurfactant (Vasconcellos et al., 2009), ceci se passe en présence de biosurfactants qui
peuvent rendre la surface cellulaire plus hydrophobe par la production de lipopolysaccharide,
augmentant ainsi l'association de la cellule avec le substrat (Al-Tahhan et al., 2000). Cette étude
soutient aussi les recherches existantes, où Gamma-protéobactérie, et dans une moindre mesure
Alpha-protéobactérie, deviennent dominantes dans les communautés bactériennes des
Code
de la
souche
Phylum
Famille
Espèce
Id.
(%)
Accession
number
PSF-5
Actinobactérie
Brevibacteriaceae
Brevibacterium celere strain KMM 3637
99% NR_025727.1
PSF-54 Protéobactérie
Alcanivoracaceae
Alcanivorax xenomutans strain JC109
99% NR_133958.1
PSF-14 Protéobactérie
Erythrobacteraceae
Erythrobacter citreus strain RE35F/1
99% NR_028741.1
PSF-18 Protéobactérie
Alcanivoracaceae
Alcanivorax dieselolei strain B5
99% NR_074734.1
PSF-12 Protéobactérie
Alcanivoracaceae
Alcanivorax borkumensis strain SK2
99% NR_074890.1
PSF-13 Protéobactérie
Halomonadaceae
Halomonas venusta strain NBRC 102221
99% NR_114048.1
PSF-21 Protéobactérie
Pseudomonadaceae
Pseudomonas taiwanensis strain BCRC 17751
99% NR_152090.1
PSF-35 Protéobactérie
Pseudomonadaceae
Pseudomonas oceani strain DSM 100277
99% NR_116172.1
PSF-90 Protéobactérie
Alcanivoracaceae
Alcanivorax borkumensis strain SK2
99% NR_074890.1
PSF-6
Actinobactérie
Gordoniaceae
Gordonia hongkongensis strain HKU50
99% NR_152023.1
PSF-42 Protéobactérie
Alteromonadaceae
Marinobacter nitratireducens strain AK21
99% NR_136469.1
PSF-23 Actinobactérie
Micrococcaceae
Micrococcus yunnanensis strain YIM 65004
99% NR_116578.1
PSF-26 Protéobactérie
Alteromonadaceae
Marinobacter hydrocarbonoclasticus strain ATCC
49840
99% NR_074619.1
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Tableau Ⅳ.2. Identification des séquences appartenant aux souches bactériennes choisis
A l’exception de trois bactéries, la majorité des bactéries testées appartiennent aux
Protéobactéries qui est un phylum majeur regroupant des bactéries à Gram-négatives. Nos
résultats sont compatibles avec les recherches précédentes qui ont trouvées que les
protéobactéries constituent le phylum le plus abondant dans plusieurs environnements,
notamment le sol (Spain et al., 2009), les sédiments (Mason et al., 2014) et l'eau de mer (Feng et
al., 2009). En outre, les protéobactéries se sont avérées être le phylum dominant dans les sites
contaminés par des hydrocarbures pétroliers (Zhang et al., 2010 ; Mukherjee et al., 2014). La
dominance de ce phylum peut être due à leur membrane lipopolysaccharide qui peut jouer le rôle
de biosurfactant (Vasconcellos et al., 2009), ceci se passe en présence de biosurfactants qui
peuvent rendre la surface cellulaire plus hydrophobe par la production de lipopolysaccharide,
augmentant ainsi l'association de la cellule avec le substrat (Al-Tahhan et al., 2000). Cette étude
soutient aussi les recherches existantes, où Gamma-protéobactérie, et dans une moindre mesure
Alpha-protéobactérie, deviennent dominantes dans les communautés bactériennes des
Code
de la
souche
Phylum
Famille
Espèce
Id.
(%)
Accession
number
PSF-5
Actinobactérie
Brevibacteriaceae
Brevibacterium celere strain KMM 3637
99% NR_025727.1
PSF-54 Protéobactérie
Alcanivoracaceae
Alcanivorax xenomutans strain JC109
99% NR_133958.1
PSF-14 Protéobactérie
Erythrobacteraceae
Erythrobacter citreus strain RE35F/1
99% NR_028741.1
PSF-18 Protéobactérie
Alcanivoracaceae
Alcanivorax dieselolei strain B5
99% NR_074734.1
PSF-12 Protéobactérie
Alcanivoracaceae
Alcanivorax borkumensis strain SK2
99% NR_074890.1
PSF-13 Protéobactérie
Halomonadaceae
Halomonas venusta strain NBRC 102221
99% NR_114048.1
PSF-21 Protéobactérie
Pseudomonadaceae
Pseudomonas taiwanensis strain BCRC 17751
99% NR_152090.1
PSF-35 Protéobactérie
Pseudomonadaceae
Pseudomonas oceani strain DSM 100277
99% NR_116172.1
PSF-90 Protéobactérie
Alcanivoracaceae
Alcanivorax borkumensis strain SK2
99% NR_074890.1
PSF-6
Actinobactérie
Gordoniaceae
Gordonia hongkongensis strain HKU50
99% NR_152023.1
PSF-42 Protéobactérie
Alteromonadaceae
Marinobacter nitratireducens strain AK21
99% NR_136469.1
PSF-23 Actinobactérie
Micrococcaceae
Micrococcus yunnanensis strain YIM 65004
99% NR_116578.1
PSF-26 Protéobactérie
Alteromonadaceae
Marinobacter hydrocarbonoclasticus strain ATCC
49840
99% NR_074619.1