Chapitre Ⅲ : matériel et méthodes
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III.3 Techniques d’échantillonnage
Le prélèvement des échantillons d’eau de mer et de sédiment, ont été effectuées depuis une
embarcation durant le mois de mars 2016. Cinq différentes stations ont été choisies pour les
prélèvements d’eau et de sédiments (Figure Ⅲ.2).
Environ un litre d’eau a été collecté de chaque station, l’échantillonnage a été effectué
manuellement dans des flacons préalablement stérilisés, à environ 30 cm sous la surface de l’eau.
Les échantillons de sédiments ont également été prélevés à partir des mêmes stations à l'aide
d'une benne de type Van Veen (Duncan et associés KC Scientific Instrument Corporation de KC
Denmark). Tous les échantillonnages pour l’étude microbiologique ont été effectués dans des
conditions stériles.
Après la collecte, les échantillons ont été immédiatement transportés au laboratoire dans une
glacière (4-8 ° C). Une fois au laboratoire, les échantillons ont été utilisés immédiatement comme
inoculum pour la culture d'enrichissement dans un milieu minéral (ONR7a) additionné
d'hydrocarbures comme unique source de carbone et d’énergie (Djahnit et al., 2019).
Figure Ⅲ.2. Localisation des stations de prélèvement d’eau de mer et de sédiments du port de
Sidi Fredj (Djahnit et al., 2019)