Chapitre II Les bactéries marines dégradantes les hydrocarbures
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rotation des moteurs flagellaires. Ce changement affecte à son tour la façon dont les bactéries nagent
dans leur environnement. Chez les organismes modèles Escherichia coli et Bacillus subtilis, Le
chimiotactisme repose sur la présence des MCPs, d’une histidine kinase particulière (CheA), de deux
régulateurs de réponse (RR) (CheY et CheB, un RR à activité méthylestérase) et d’une
méthyltransférase constitutive (CheR) qui permet la méthylation à partir de S-adénosylméthionine de
résidus glutamates des récepteurs MCPs. La fixation d’une molécule attractive ou répulsive sur le
récepteur modifie l’activité d’auto-phosphorylation normale de CheA, associée aux récepteurs par
l’intermédiaire d’une protéine adaptatrice CheW. La formation de CheA-P permet la phosphorylation
de CHeY. C’est la forme phosphorylée du RR CheY-P qui induit un changement du sens de rotation
du flagelle en se fixant sur le moteur flagellaire (Prescott et al., 2003 ; Sourjik et Armitage, 2010 ;
Wadhams et Armitage, 2004).
Ce processus joue un rôle dans la biodégradation en mettant les cellules en contact avec les substrats
de dégradation (Parales et Harwood, 2002 ; Parales et al., 2008). Les alcanes sont des sources de
carbone et d'énergie pour de nombreuses espèces bactériennes et il a été démontré qu'ils fonctionnent
comme des chimio-attractifs pour certains micro-organismes. Un isolat bactérien de Flavimonas
oryzihabitans, obtenu à partir d'un sol contaminé par des hydrocarbures, s'est révélé chimiotactique
vis-à-vis l'hexadécane (Lanfranconi et al., 2003). De même, Pseudomonas aeruginosa est
chimiotactique à l'hexadécane (Smits et al., 2003). Le gène tlpS, qui est situé en aval du gène de
l'alcane hydroxylase alkB1 dans le génome de P. aeruginosa, est prédit pour coder des récepteurs
transmembranaires appelés methyl accepting chemotaxis proteins (MCP) qui peuvent jouer un rôle
dans le chimiotactisme des alcanes (Smits et al., 2003). De même, le gène alkN est prédit pour coder
une MCP qui pourrait être impliquée dans le chimiotactisme des alcanes dans P. putida (van Beilen et
al., 2001). Une enquête sur la séquence du génome d'Alcanivorax dieselolei (Lai et al., 2012) a
identifié la machinerie de chimiotaxie des alcanes d'Alcanivorax, qui consiste en huit protéines
cytoplasmiques qui transmettent les signaux des protéines MCP aux moteurs flagellaires (Figure Ⅱ.4).
Cette machinerie de chimiotactisme est similaire à celle d'Escherichia coli (Parales et Ditty, 2010).
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rotation des moteurs flagellaires. Ce changement affecte à son tour la façon dont les bactéries nagent
dans leur environnement. Chez les organismes modèles Escherichia coli et Bacillus subtilis, Le
chimiotactisme repose sur la présence des MCPs, d’une histidine kinase particulière (CheA), de deux
régulateurs de réponse (RR) (CheY et CheB, un RR à activité méthylestérase) et d’une
méthyltransférase constitutive (CheR) qui permet la méthylation à partir de S-adénosylméthionine de
résidus glutamates des récepteurs MCPs. La fixation d’une molécule attractive ou répulsive sur le
récepteur modifie l’activité d’auto-phosphorylation normale de CheA, associée aux récepteurs par
l’intermédiaire d’une protéine adaptatrice CheW. La formation de CheA-P permet la phosphorylation
de CHeY. C’est la forme phosphorylée du RR CheY-P qui induit un changement du sens de rotation
du flagelle en se fixant sur le moteur flagellaire (Prescott et al., 2003 ; Sourjik et Armitage, 2010 ;
Wadhams et Armitage, 2004).
Ce processus joue un rôle dans la biodégradation en mettant les cellules en contact avec les substrats
de dégradation (Parales et Harwood, 2002 ; Parales et al., 2008). Les alcanes sont des sources de
carbone et d'énergie pour de nombreuses espèces bactériennes et il a été démontré qu'ils fonctionnent
comme des chimio-attractifs pour certains micro-organismes. Un isolat bactérien de Flavimonas
oryzihabitans, obtenu à partir d'un sol contaminé par des hydrocarbures, s'est révélé chimiotactique
vis-à-vis l'hexadécane (Lanfranconi et al., 2003). De même, Pseudomonas aeruginosa est
chimiotactique à l'hexadécane (Smits et al., 2003). Le gène tlpS, qui est situé en aval du gène de
l'alcane hydroxylase alkB1 dans le génome de P. aeruginosa, est prédit pour coder des récepteurs
transmembranaires appelés methyl accepting chemotaxis proteins (MCP) qui peuvent jouer un rôle
dans le chimiotactisme des alcanes (Smits et al., 2003). De même, le gène alkN est prédit pour coder
une MCP qui pourrait être impliquée dans le chimiotactisme des alcanes dans P. putida (van Beilen et
al., 2001). Une enquête sur la séquence du génome d'Alcanivorax dieselolei (Lai et al., 2012) a
identifié la machinerie de chimiotaxie des alcanes d'Alcanivorax, qui consiste en huit protéines
cytoplasmiques qui transmettent les signaux des protéines MCP aux moteurs flagellaires (Figure Ⅱ.4).
Cette machinerie de chimiotactisme est similaire à celle d'Escherichia coli (Parales et Ditty, 2010).