xxviii
Table des matières
concept 25.4 L’ascension et le déclin des groupes
d’organismes sont le reflet des différences
marquant les taux de spéciation et d’extinction . .
600
La tectonique des plaques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
600
Les extinctions massives . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
602
Les radiances adaptatives
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
605
concept 25.5 Des variations dans les séquences
et la régulation des gènes développementaux
peuvent entraîner des modifications
morphologiques majeures . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
606
L’effet des gènes développementaux . . . . . . . . . . . .
607
L’évolution du développement . . . . . . . . . . . . . . . . .
608
concept 25.6 L’évolution ne vise aucun objectif . .
609
Les innovations de l’évolution . . . . . . . . . . . . . . . . .
611
Les tendances évolutives . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
612
Révision du chapitre 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
613
CINqUIèMe PArtIe La diversité biologique
à travers l’évolution
Chapitre 26 La phylogenèse
et l’arbre de la vie
619
introduction L’étude de l’arbre de la vie . . . . . . . .
619
concept 26.1 La phylogenèse révèle les liens
de parenté évolutive . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
620
La nomenclature binominale . . . . . . . . . . . . . . . . . .
620
La classification hiérarchique . . . . . . . . . . . . . . . . . .
620
La classification et la phylogenèse . . . . . . . . . . . . . .
620
Les avantages et les limites de l’arbre
phylogénétique . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
622
La phylogenèse appliquée . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
622
concept 26.2 La phylogenèse repose sur
des données morphologiques et moléculaires . . . .
623
Les homologies morphologiques
et moléculaires
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
623
Distinguer homologie et analogie . . . . . . . . . . . . . .
624
L’évaluation des homologies moléculaires . . . . . . . .
625
concept 26.3 Les arbres phylogénétiques
sont construits à partir de caractères communs . . . .
626
La cladistique . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
626
Les arbres phylogénétiques et la longueur
proportionnelle des branches . . . . . . . . . . . . . . . .
627
La parcimonie maximale et la probabilité
maximale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
628
Les arbres phylogénétiques en tant
qu’hypothèses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
631
concept 26.4 Le génome recèle l’histoire
évolutive de tout organisme . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
632
Les duplications de gènes et les familles
de gènes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
632
L’évolution du génome . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
633
concept 26.5 Les horloges moléculaires rendent
compte du temps de l’évolution . . . . . . . . . . . . . . . .
633
Les horloges moléculaires . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
634
La datation de l’origine du VIH à l’aide
d’une horloge moléculaire . . . . . . . . . . . . . . . . . .
635
concept 26.6 De nouvelles données enrichissent
continuellement notre compréhension de l’arbre
de la vie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
636
De deux règnes à trois domaines . . . . . . . . . . . . . . .
636
L’arbre simplifié de la vie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
636
L’arbre de la vie est-il vraiment circulaire ? . . . . . . .
637
Révision du chapitre 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
638
Chapitre 27 Bactéries et Archées
643
introduction Les maîtres de l’adaptation . . . . . . . .
643
concept 27.1 Des adaptations structurales,
fonctionnelles et génétiques contribuent
au succès des Procaryotes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
643
Les structures de la surface cellulaire . . . . . . . . . . . .
644
La motilité . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
645
Structure interne et ADN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
646
Reproduction et adaptation . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
647
concept 27.2 La reproduction et les mutations
rapides, de même que la recombinaison
génétique, favorisent la diversité génétique
des Procaryotes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
648
La reproduction et les mutations rapides . . . . . . . .
648
La recombinaison génétique . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
649
concept 27.3 De très nombreuses adaptations
nutritionnelles et métaboliques sont apparues
chez les Procaryotes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
652
Le rôle du dioxygène dans le métabolisme . . . . . . .
652
Le métabolisme de l’azote . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
652
La coopération métabolique . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
652
concept 27.4 La systématique moléculaire
fait la lumière sur la phylogenèse
des Procaryotes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
653
Les leçons tirées de la systématique
moléculaire . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
653
Les Archées . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
654
Les Bactéries . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
655
concept 27.5 Les Procaryotes remplissent
des fonctions essentielles dans la biosphère . . . . . .
658
Le recyclage des éléments chimiques . . . . . . . . . . . .
658
Les interactions écologiques . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
658
concept 27.6 Les Procaryotes ont sur les humains
des effets tant défavorables que bénéfiques . . . . . .
659
Les Bactéries mutualistes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
659
Les Bactéries pathogènes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
659
L’utilisation des Procaryotes pour la recherche
et la technologie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
660
Révision du chapitre 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
662
Table des matières
concept 25.4 L’ascension et le déclin des groupes
d’organismes sont le reflet des différences
marquant les taux de spéciation et d’extinction . .
600
La tectonique des plaques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
600
Les extinctions massives . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
602
Les radiances adaptatives
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
605
concept 25.5 Des variations dans les séquences
et la régulation des gènes développementaux
peuvent entraîner des modifications
morphologiques majeures . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
606
L’effet des gènes développementaux . . . . . . . . . . . .
607
L’évolution du développement . . . . . . . . . . . . . . . . .
608
concept 25.6 L’évolution ne vise aucun objectif . .
609
Les innovations de l’évolution . . . . . . . . . . . . . . . . .
611
Les tendances évolutives . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
612
Révision du chapitre 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
613
CINqUIèMe PArtIe La diversité biologique
à travers l’évolution
Chapitre 26 La phylogenèse
et l’arbre de la vie
619
introduction L’étude de l’arbre de la vie . . . . . . . .
619
concept 26.1 La phylogenèse révèle les liens
de parenté évolutive . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
620
La nomenclature binominale . . . . . . . . . . . . . . . . . .
620
La classification hiérarchique . . . . . . . . . . . . . . . . . .
620
La classification et la phylogenèse . . . . . . . . . . . . . .
620
Les avantages et les limites de l’arbre
phylogénétique . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
622
La phylogenèse appliquée . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
622
concept 26.2 La phylogenèse repose sur
des données morphologiques et moléculaires . . . .
623
Les homologies morphologiques
et moléculaires
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
623
Distinguer homologie et analogie . . . . . . . . . . . . . .
624
L’évaluation des homologies moléculaires . . . . . . . .
625
concept 26.3 Les arbres phylogénétiques
sont construits à partir de caractères communs . . . .
626
La cladistique . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
626
Les arbres phylogénétiques et la longueur
proportionnelle des branches . . . . . . . . . . . . . . . .
627
La parcimonie maximale et la probabilité
maximale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
628
Les arbres phylogénétiques en tant
qu’hypothèses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
631
concept 26.4 Le génome recèle l’histoire
évolutive de tout organisme . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
632
Les duplications de gènes et les familles
de gènes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
632
L’évolution du génome . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
633
concept 26.5 Les horloges moléculaires rendent
compte du temps de l’évolution . . . . . . . . . . . . . . . .
633
Les horloges moléculaires . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
634
La datation de l’origine du VIH à l’aide
d’une horloge moléculaire . . . . . . . . . . . . . . . . . .
635
concept 26.6 De nouvelles données enrichissent
continuellement notre compréhension de l’arbre
de la vie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
636
De deux règnes à trois domaines . . . . . . . . . . . . . . .
636
L’arbre simplifié de la vie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
636
L’arbre de la vie est-il vraiment circulaire ? . . . . . . .
637
Révision du chapitre 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
638
Chapitre 27 Bactéries et Archées
643
introduction Les maîtres de l’adaptation . . . . . . . .
643
concept 27.1 Des adaptations structurales,
fonctionnelles et génétiques contribuent
au succès des Procaryotes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
643
Les structures de la surface cellulaire . . . . . . . . . . . .
644
La motilité . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
645
Structure interne et ADN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
646
Reproduction et adaptation . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
647
concept 27.2 La reproduction et les mutations
rapides, de même que la recombinaison
génétique, favorisent la diversité génétique
des Procaryotes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
648
La reproduction et les mutations rapides . . . . . . . .
648
La recombinaison génétique . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
649
concept 27.3 De très nombreuses adaptations
nutritionnelles et métaboliques sont apparues
chez les Procaryotes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
652
Le rôle du dioxygène dans le métabolisme . . . . . . .
652
Le métabolisme de l’azote . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
652
La coopération métabolique . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
652
concept 27.4 La systématique moléculaire
fait la lumière sur la phylogenèse
des Procaryotes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
653
Les leçons tirées de la systématique
moléculaire . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
653
Les Archées . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
654
Les Bactéries . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
655
concept 27.5 Les Procaryotes remplissent
des fonctions essentielles dans la biosphère . . . . . .
658
Le recyclage des éléments chimiques . . . . . . . . . . . .
658
Les interactions écologiques . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
658
concept 27.6 Les Procaryotes ont sur les humains
des effets tant défavorables que bénéfiques . . . . . .
659
Les Bactéries mutualistes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
659
Les Bactéries pathogènes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
659
L’utilisation des Procaryotes pour la recherche
et la technologie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
660
Révision du chapitre 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
662