10.3.3 Cold-Water Coral Mound Characterization. . . . . . . . . . . 264
10.3.4 Mound Morphometrics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 269
10.3.5 Habitat Classification Map . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 269
10.4 Conclusions and Recommendations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 278
Suggested Reading . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 280
References . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 280
Section IV Thermal and Radar
11 Thermal and Radar Overview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 285
11.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 286
11.2 Thermal Overview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 286
11.2.1 Thermal Physical Principles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 286
11.2.2 Acquisition Logistics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 291
11.2.3 History of Thermal Monitoring. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 294
11.2.4 Thermal Processing Requirements. . . . . . . . . . . . . . . . . 297
11.2.5 Thermal Validation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298
11.3 Radar Overview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298
11.3.1 Radar Physical Principles. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298
11.3.2 Radar Systems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 303
11.3.3 Radar Processing Requirements . . . . . . . . . . . . . . . . . . 308
11.3.4 Radar Validation. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 309
11.4 Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 310
Suggested Reading . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 310
References . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 311
12 Thermal Applications. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 313
12.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 314
12.1.1 Infrared and Microwave Sensors . . . . . . . . . . . . . . . . . . 314
12.1.2 Measurement Accuracies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 315
12.1.3 Quality Control. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 317
12.2 Thermal Data Products and Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 318
12.2.1 AVHRR Pathfinder Series . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 318
12.2.2 Group for High-Resolution SST . . . . . . . . . . . . . . . . . . 319
12.2.3 Quantifying Trends and Changes . . . . . . . . . . . . . . . . . 320
12.2.4 Application to Reef Management . . . . . . . . . . . . . . . . . 324
12.2.5 Limitations. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 327
12.3 Example Thermal Applications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 327
12.3.1 Marine Protected Area Design . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 328
12.3.2 Water Quality and Coral Bleaching. . . . . . . . . . . . . . . . 330
12.3.3 Coastal and Oceanic Upwelling . . . . . . . . . . . . . . . . . . 331
12.4 Future Directions. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 333
Suggested Reading . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335
References . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335
Contents
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10.3.4 Mound Morphometrics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 269
10.3.5 Habitat Classification Map . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 269
10.4 Conclusions and Recommendations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 278
Suggested Reading . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 280
References . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 280
Section IV Thermal and Radar
11 Thermal and Radar Overview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 285
11.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 286
11.2 Thermal Overview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 286
11.2.1 Thermal Physical Principles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 286
11.2.2 Acquisition Logistics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 291
11.2.3 History of Thermal Monitoring. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 294
11.2.4 Thermal Processing Requirements. . . . . . . . . . . . . . . . . 297
11.2.5 Thermal Validation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298
11.3 Radar Overview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298
11.3.1 Radar Physical Principles. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298
11.3.2 Radar Systems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 303
11.3.3 Radar Processing Requirements . . . . . . . . . . . . . . . . . . 308
11.3.4 Radar Validation. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 309
11.4 Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 310
Suggested Reading . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 310
References . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 311
12 Thermal Applications. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 313
12.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 314
12.1.1 Infrared and Microwave Sensors . . . . . . . . . . . . . . . . . . 314
12.1.2 Measurement Accuracies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 315
12.1.3 Quality Control. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 317
12.2 Thermal Data Products and Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 318
12.2.1 AVHRR Pathfinder Series . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 318
12.2.2 Group for High-Resolution SST . . . . . . . . . . . . . . . . . . 319
12.2.3 Quantifying Trends and Changes . . . . . . . . . . . . . . . . . 320
12.2.4 Application to Reef Management . . . . . . . . . . . . . . . . . 324
12.2.5 Limitations. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 327
12.3 Example Thermal Applications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 327
12.3.1 Marine Protected Area Design . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 328
12.3.2 Water Quality and Coral Bleaching. . . . . . . . . . . . . . . . 330
12.3.3 Coastal and Oceanic Upwelling . . . . . . . . . . . . . . . . . . 331
12.4 Future Directions. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 333
Suggested Reading . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335
References . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335
Contents
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