Molecular Detection of Seafood Borne Human Pathogenic Bacteria 107
CTX2
CGG-GCA-GAT-TCT-AGA-CCT-CCT-G
564
ctxA
DePaola and Hwang (1995)
from Fields et al. (1992)
CTX3
CGA-TGA-TCT-TGG-AGC-ATT-CCC-AC
” ” ”
” ” ” ”
”
STO-F
CAT-GAG-AAA-CCT-ATT-CAT-TGC
238
sto
Ripabelli et al. (1999)
STO-R
TTA-ATT-TAA-ACA-TCC-AAA-GCA-AG
” ” ”
”
ompW-F
CAC-CAA-GAA-GGT-GAC-TTT-ATT-GTG
588
ompW
Nandi et al. 2000)
ompW-R
GAA-CTT-ATA-ACC-ACC-CGC-G
” ” ”
”
toxR-F
ATG-TTC-GGA-TTA-GGA-CAC
883
toxR
” ” ”
”
toxR-R
TAC-TCA-CAC-ACT-TTG-ATG-GC
” ” ”
”
ctxA-F
CTC-AGA-CGG-GAT-TTG-TTA-GGC-ACG
301
ctxA
” ” ”
”
ctxA-R
TCT-ATC-TCT-GTA-GCC-CCT-ATT-ACG
” ” ”
”
rtxC-F
CGA-CGA-AGA-TCA-TTG-ACG-AC
265
rtx
Fukushima et al. (2003)
rtxC-r
CAT-CGT-CGT-TAT-GTG-GTT-GC
” ” ”
”
CT-F
ACA-GAG-TGA-GTA-CTT-TGA-CC
308
ctx
” ” ” from Nair et al.
(1994)
CT-R
ATA-CCA-TCC-ATA-TAT-TTG-GGA-G
“ “ “ ” ” ”
”
ctxA-F
TTT-GTT-AGG-CAC-GAT-GAT-GGA-T
-
ctx
Blackstone et al. (2007)
ctxA-R
ACC-AGA-CAA-TAT-AGT-TTG-ACC-CAC-G
” ” ”
”
ctxAP
FAM/TET-TGT-TTC-CAC-CTC-AAT-AGT-TTG” ” ”
”
AGA-AGT-GCC-C-BHQ
VHMF
TGG-GAG-CAG-CGT-CCA-TTG-TG
519
lolB
Lalitha et al.(2008)
VHA-AS5
CAA-TCA-CAC-CAA-GTC-ACT-C
”
”
” ” ”
”
GF-1
AAA-AGT-CAT-ATC-TAT-GGA-TA
762
bont/E
Hielm et al. (1996) from
Franciosa et al. (1994)
GF-3
GTG-TTA-TAG-TAT-ACA-TTG-TAG-TAA-TCC
” ” ”
” ” ”
”
”
”
Table 5.1 contd...
Primer
Sequence (5’ —> 3’)
Size of amplifi ed
Gene
Reference
or probe
sequence (bp’s)