Glossaire
200
Indel : événement évolutif conduisant à un gain (insertion) ou une perte (délétion)
d’un fragment de séquence.
Intéine : segment protéique éliminé par un processus catalytique d’auto-épissage.
Leave one out : méthode de validation consistant à sortir un élément de la référence
pour s’affranchir de l’effet de la connaissance du résultat le concernant.
Matrice de substitution : table de conversion des bases ou des acides aminés.
Module : élément de séquence retrouvé dans des protéines de fonctions différentes.
Motif : architecture structurale au niveau de la chaîne principale responsable d’une
fonction biologique (motif de fixation de nucléotides).
Ontologie : vocabulaire et sémantique contrôlés dans un domaine partagé.
Orthologue : deux séquences homologues sont de plus orthologues si elles ont
divergé l’une de l’autre lors d’une spéciation.
Palindrome : mot qui se lit indifféremment dans les deux sens comme LAVAL. Par
extension peut s’appliquer à une phrase symétrique (Esope reste ici et se repose).
Paralogue : deux séquences homologues sont de plus paralogues si elles ont divergé
l’une de l’autre lors d’une duplication génique.
Point isoélectrique : pH auquel la charge globale d’une protéine est nulle.
Repliement ou Architecture : disposition dans l’espace des éléments de structures
secondaires en faisant abstraction des connexions
Résolution : distance minimale entre deux objets apparaissant séparés.
Séquence : ordre de succession des bases (acides nucléiques) ou acides aminés
(protéines).
Signature : séquence caractéristique d’une fonction ou d’une structure.
Site : ensemble d’atomes qui participe directement à une fonction biologique (catalyse ou reconnaissance).
Stochastique : synonyme d’aléatoire.
Structure primaire : niveau d’organisation des protéines correspondant à la
séquence.
« Sur-apprentissage » : biais qui se caractérise par une perte de pouvoir de prédiction sur de nouveaux éléments qui n’ont pas été utilisés pour l’apprentissage.
Transition : substitution entre bases puriques (A ou G) ou entre bases pyrimidiques
(C, T ou U).
Transposition : déplacements de fragments dans des séquences (le plus souvent par
insertion ou par échange de gènes).
Transversion : substitution d’une base purique par une base pyrimidique ou vice-versa.
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Indel : événement évolutif conduisant à un gain (insertion) ou une perte (délétion)
d’un fragment de séquence.
Intéine : segment protéique éliminé par un processus catalytique d’auto-épissage.
Leave one out : méthode de validation consistant à sortir un élément de la référence
pour s’affranchir de l’effet de la connaissance du résultat le concernant.
Matrice de substitution : table de conversion des bases ou des acides aminés.
Module : élément de séquence retrouvé dans des protéines de fonctions différentes.
Motif : architecture structurale au niveau de la chaîne principale responsable d’une
fonction biologique (motif de fixation de nucléotides).
Ontologie : vocabulaire et sémantique contrôlés dans un domaine partagé.
Orthologue : deux séquences homologues sont de plus orthologues si elles ont
divergé l’une de l’autre lors d’une spéciation.
Palindrome : mot qui se lit indifféremment dans les deux sens comme LAVAL. Par
extension peut s’appliquer à une phrase symétrique (Esope reste ici et se repose).
Paralogue : deux séquences homologues sont de plus paralogues si elles ont divergé
l’une de l’autre lors d’une duplication génique.
Point isoélectrique : pH auquel la charge globale d’une protéine est nulle.
Repliement ou Architecture : disposition dans l’espace des éléments de structures
secondaires en faisant abstraction des connexions
Résolution : distance minimale entre deux objets apparaissant séparés.
Séquence : ordre de succession des bases (acides nucléiques) ou acides aminés
(protéines).
Signature : séquence caractéristique d’une fonction ou d’une structure.
Site : ensemble d’atomes qui participe directement à une fonction biologique (catalyse ou reconnaissance).
Stochastique : synonyme d’aléatoire.
Structure primaire : niveau d’organisation des protéines correspondant à la
séquence.
« Sur-apprentissage » : biais qui se caractérise par une perte de pouvoir de prédiction sur de nouveaux éléments qui n’ont pas été utilisés pour l’apprentissage.
Transition : substitution entre bases puriques (A ou G) ou entre bases pyrimidiques
(C, T ou U).
Transposition : déplacements de fragments dans des séquences (le plus souvent par
insertion ou par échange de gènes).
Transversion : substitution d’une base purique par une base pyrimidique ou vice-versa.