Chapitre 10 • Prédictions de structures secondaires
128
• Exemple de peptide similaire
Le tableau suivant est rempli :
Supposons que pour le même peptide à prédire, un autre peptide similaire soit
trouvé dans la base :
Le tableau précédent est remis à jour :
Peptide à prédire
A
V
K
L
M
S
T
Substitution
1
2
2
2
2
2
2
= 13
Peptide de la base de données
E
V
K
L
M
S
T
Structure observée
H
H
H
H
E
E
C
Tableau 10.8 – Remplissage du tableau des scores conformationnels.
Conformations
AA
Hélice
Autre
Brin
A
13
V
13
K
13
L
13
M
13
S
13
T
13
Peptide à prédire
A
V
K
L
M
S
T
= 9
Substitution
1
1
1
2
2
0
2
Peptide de la base de données
S
L
R
L
L
T
T
Structure observée
C
H
H
H
H
H
E
Tableau 10.9 – Accumulation des scores.
Conformations
AA
Hélice
Brin
Autre
A
13
9
V
13 + 9
K
13 + 9
L
13 + 9
M
9
13
S
9
13
T
9
13