Table des matières

 

 

 
II.3 Aspects métaboliques de la biodégradation des hydrocarbures pétroliers. ................ 46
II.4 Facteurs influençant la biodégradation en mer. .......................................................... 47
II.4.1 Effets des facteurs environnementaux. ................................................................. 47
II.4.1.1 Effet de la température. .................................................................................. 47
II.4.1.2 Effet de l’oxygène. ......................................................................................... 49
II.4.1.3 Effet du pH. .................................................................................................... 50
II.4.1.4 Effet de la salinité. .......................................................................................... 50
II.4.1.5 Effet de la pression hydrostatique. ................................................................. 50
II.4.1.6 Concentration en sels nutritifs. ....................................................................... 51
II.4.2 La composition chimique des hydrocarbures. ...................................................... 52
II.4.3 Biodisponibilité des hydrocarbures. ..................................................................... 53
II.5 Accession des microorganismes aux hydrocarbures. ................................................. 54
II.5.1 L’assimilation des hydrocarbures solubles : ........................................................ 54
II.5.2 L’accession interfaciale. ....................................................................................... 54
II.5.3 L’accession interfaciale facilitée (émulsification). .............................................. 55
II.5.4 Le transfert micellaire. ......................................................................................... 55
II.6 Les biosurfactants. ...................................................................................................... 55
II.7 Études de cas de stratégies de bioremédiation utilisées pour la décontamination des
milieux marins pollués ......................................................................................................... 58
II.8 Les Voies de biodégradation des hydrocarbures pétroliers. ....................................... 60
II.8.1 Biodégradation aérobie. ........................................................................................ 61
II.8.1.1 Voies métaboliques de la dégradation des hydrocarbures aliphatiques. ........ 61
II.8.1.1.1 Biodégradation des n-alcanes. ...................................................................... 61
II.8.1.1.2 Biodégradation des alcanes ramifiés. ........................................................... 63
II.8.1.1.3 Voies métaboliques de dégradation des hydrocarbures saturés cycliques… 64
II.8.1.2 Biodégradation des hydrocarbures aromatiques. ............................................ 65
II.8.2 Biodégradation anaérobie des hydrocarbures. ...................................................... 66
II.9 Gènes impliqués dans la biodégradation. ................................................................... 70
II.10 Méthodes d'étude des communautés microbiennes dégradants les hydrocarbures .. 72
Conclusions…………………………………………………………………………………..73
CHAPITRE III : Zone d’étude et échantillonnage
III.1 Le port de Sidi Fredj. ................................................................................................. 75
III.1.1 Situation géographique. ....................................................................................... 75
III.1.2 Configuration et infrastructures du port. ............................................................. 75
III.1.3 Caractéristiques du port. ...................................................................................... 76
III.1.3.1 Bathymétrie. .................................................................................................. 76
III.1.3.2 Topographie. .................................................................................................. 77
III.1.3.3 Sédimentologie. ............................................................................................. 78
III.1.4 Facteurs hydrodynamiques. ................................................................................. 79
III.1.4.1 Facteurs météorologiques. ............................................................................. 79
III.1.4.1.1 Vents ............................................................................................................. 79
III.1.4.1.2 Température et précipitation. ........................................................................ 79
III.1.4.2 Facteurs océaniques. ...................................................................................... 80
III.1.4.2.1 Les courants. ................................................................................................. 80
III.1.4.2.2 Les houles. .................................................................................................... 80