CHAPITRE V
Résultats & Discussion

 

 
 
 
 
 

 
128
 
V.8 Analyses phylogénétiques.
Figure 46. Cladogramme basé sur les alignements des séquences 16S des différentes
bactéries. Les distances génétiques sont indiquées à droite.
1. Xg
100
2. Gh
72.45
100
3. Bc
71.71
87.70
100
4. My
71.82
89.31
90.66
100
5. Ec
73.17
77.69
76.29
77.86
100
6. La
73.46
78.86
75.61
77.48
89.39
100
7. Po
71.16
76.61
74.91
76.88
80.53
81.14
100
8. Pt
71.67
76.46
75.28
76.66
80.83
81.59
95.64
100
9. Ab
72.37
76.88
77.10
78.02
80.53
80.91
86.91
86.98
100
10. Ax
72.02
77.57
76.38
77.75
80.33
81.70
87.24
87.83
93.39
100
11. Ad
72.79
78.12
76.93
78.30
80.74
82.11
88.14
88.72
94.13
98.98
100
12. Hv
72.03
76.31
76.17
76.72
79.10
80.47
86.34
86.56
86.96
86.72
87.54
100
13.Mz
71.57
75.91
74.28
75.65
79.77
81.36
88.29
88.73
88.32
87.72
88.61
89.00
100
14.Mh
72.37
76.50
75.61
75.79
79.47
80.98
88.00
88.87
88.90
87.79
88.61
89.37
95.21
100
15.Mn
73.01
75.81
75.00
75.85
79.91
80.74
88.36
89.52
89.55
89.16
90.05
88.19
95.36
96.15
100
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
Figure 47. Matrice d’identité entre les séquences 16S des bactéries identifiées prises deux à
deux. Xg : Xanthomarina gelatinilytica ; Gh : Gordonia Honghongensis ; Bc :
Brevibacterium celere ; My : Micrococcus yunnanensis ; Ec : Erythrobacter citreus ; La :
Labrenzia aggregata ; Po : Pseudomonas oceani ; Pt : Pseudomonas taiwanensis ; Ab :
Alcanivorax burkomensis ; Ax : Alcanivorax xenomutans ; Ad : Alcanivorax dieselolei ; Hv :
Halomonas venusta ; Mz : Marinobacter zhanjianfensis ; Mh : Marinobacter
hydrocarbonoclasticus ; Mn : Marinobacter nitratireducens.
70 à 74.99%
75 à 79.99%
80 à 84.99%
85.00à 89.99%
90.00 à 94.99%
≥95%