CHAPITRE V
Résultats & Discussion
126
Dans les milieux pollués, la diversité microbienne diminue et seule des souches capables
d’utiliser les hydrocarbures survivent et prédominent (Huang et al., 2010). Ces données
peuvent expliquer la prédominance des deux genres bactériens identifiés (Alcanivorax et
Marinobacter) sur le reste des populations, mais sans pour autant négliger l’importance de
chaque membre de la communauté microbienne qui fonctionne en consortium.
Les bactéries hydrocarbonoclastes telles qu’Alcanivorax et Marinobacter sont bien connues
pour leur capacité à dégrader les hydrocarbures seuls avec un taux élevé (Cappello et al.,
2016), mais une seule espèce ne peut métaboliser qu’un nombre limité de substrats
d’hydrocarbures car elle ne possède pas toute la machinerie enzymatique nécessaire pour
dégrader un polluant jusqu’à sa minéralisation complète (Mahjoubi et al., 2013). Pour cette
raison, un consortium de nombreuses espèces bactériennes différentes, ayant de larges
capacités enzymatiques, est généralement impliqué dans la dégradation du pétrole (Röling et
al., 2002; De Pasquale et al., 2012). La présence d’Alcanivorax et de Marinobacter dans des
environnements naturels est généralement associée à la présence d'autres souches
bactériennes (Santisi et al., 2015).
Dans cette étude, d'autres genres tels que Pseudomonas, Erythrobacter, Gordonia,
Halomonas, Labrenzia ont été isolés. Ces souches ne peuvent pas être classées comme
bactéries hydrocarbonoclastes mais sont des agents dégradants d'hydrocarbures généralistes.
Les genres Halomonas et Pseudomonas jouent un rôle important dans la dégradation des
hydrocarbures halogénés et dans les mécanismes de «récupération assistée du pétrole par des
microbes» (MEOR), dans les réservoirs de pétrole (Piubeli et al., 2014 ; Gao et al., 2015).
Pseudomonas est l’un des genres bactériens les plus ubiquistes dans le monde, et différentes
espèces ont été isolées de niches écologiques diverses. Il est très souvent dominant dans les
sites contaminés aux hydrocarbures (Evans et al., 2004). Il semble être impliqué dans les
premières phases des procédés de bioremédiation lorsque les polluants sont disponibles
(Kaplan et Kitt, 2004). Erythrobacter et Labrenzia ont été identifiés en tant que dégradeurs
d’hydrocarbures aromatiques (Al-Awadhi et al. ; 2012; Gao et al., 2015), tandis que Gordonia
aurait fréquemment été décrite comme pouvant utiliser des composés aliphatiques ou
aromatiques comme substrat de croissance (Lo Piccolo et al., 2011).
D’autres bactéries à Gram positif appartenant aux groupes micrococcaceae et
brevibacteriaceae, ont été isolées et ont souvent été décrites dans la littérature comme étant
isolées d’environnements contaminés par des hydrocarbures (Chaillan et al., 2004).
Un isolat a été identifiés comme appartenant aux Bacteroidetes-Chlorobi (Flavobacteria et
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Dans les milieux pollués, la diversité microbienne diminue et seule des souches capables
d’utiliser les hydrocarbures survivent et prédominent (Huang et al., 2010). Ces données
peuvent expliquer la prédominance des deux genres bactériens identifiés (Alcanivorax et
Marinobacter) sur le reste des populations, mais sans pour autant négliger l’importance de
chaque membre de la communauté microbienne qui fonctionne en consortium.
Les bactéries hydrocarbonoclastes telles qu’Alcanivorax et Marinobacter sont bien connues
pour leur capacité à dégrader les hydrocarbures seuls avec un taux élevé (Cappello et al.,
2016), mais une seule espèce ne peut métaboliser qu’un nombre limité de substrats
d’hydrocarbures car elle ne possède pas toute la machinerie enzymatique nécessaire pour
dégrader un polluant jusqu’à sa minéralisation complète (Mahjoubi et al., 2013). Pour cette
raison, un consortium de nombreuses espèces bactériennes différentes, ayant de larges
capacités enzymatiques, est généralement impliqué dans la dégradation du pétrole (Röling et
al., 2002; De Pasquale et al., 2012). La présence d’Alcanivorax et de Marinobacter dans des
environnements naturels est généralement associée à la présence d'autres souches
bactériennes (Santisi et al., 2015).
Dans cette étude, d'autres genres tels que Pseudomonas, Erythrobacter, Gordonia,
Halomonas, Labrenzia ont été isolés. Ces souches ne peuvent pas être classées comme
bactéries hydrocarbonoclastes mais sont des agents dégradants d'hydrocarbures généralistes.
Les genres Halomonas et Pseudomonas jouent un rôle important dans la dégradation des
hydrocarbures halogénés et dans les mécanismes de «récupération assistée du pétrole par des
microbes» (MEOR), dans les réservoirs de pétrole (Piubeli et al., 2014 ; Gao et al., 2015).
Pseudomonas est l’un des genres bactériens les plus ubiquistes dans le monde, et différentes
espèces ont été isolées de niches écologiques diverses. Il est très souvent dominant dans les
sites contaminés aux hydrocarbures (Evans et al., 2004). Il semble être impliqué dans les
premières phases des procédés de bioremédiation lorsque les polluants sont disponibles
(Kaplan et Kitt, 2004). Erythrobacter et Labrenzia ont été identifiés en tant que dégradeurs
d’hydrocarbures aromatiques (Al-Awadhi et al. ; 2012; Gao et al., 2015), tandis que Gordonia
aurait fréquemment été décrite comme pouvant utiliser des composés aliphatiques ou
aromatiques comme substrat de croissance (Lo Piccolo et al., 2011).
D’autres bactéries à Gram positif appartenant aux groupes micrococcaceae et
brevibacteriaceae, ont été isolées et ont souvent été décrites dans la littérature comme étant
isolées d’environnements contaminés par des hydrocarbures (Chaillan et al., 2004).
Un isolat a été identifiés comme appartenant aux Bacteroidetes-Chlorobi (Flavobacteria et