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1 Généralités
1.1 Les inventaires de la diversité biologique marine
L’utilisation des inventaires de la biodiversité prend de plus en plus d’importance dans différents
domaines de la conservation et de la valorisation des ressources marine vivantes. L’élaboration et le
partage de ces inventaires sont devenus aujourd’hui incontournables pour la planification et l’utilisation
de l’espace marin et côtier et pour évaluer les effets des activités humaines et des facteurs naturels sur
l’évolution de la structure de la biodiversité marine. Ces inventaires permettent de suivre cette évolution
et toutes les modifications qui peuvent affecter la diversité des espèces, la complexité de la chaine
écologique : structure, raréfaction, disparition ou apparition de nouvelles espèces recherchées en priorité
lors de la mise à jour des inventaires de la biodiversité marine.
La notion d’inventaires a sensiblement évolué depuis les premiers inventaires naturalistes, sous forme
de listes d’espèces présentes sur un espace donné à un moment donné, généralement qualitatif
(présence), parfois quantitatif (effectifs, % de recouvrement), pour être appuyés de nos jours par les
études de la génomique et la biologie moléculaire. Les inventaires de la biodiversité sont réalisés pour
mieux comprendre la nature et protéger la biodiversité, à travers la distribution des espèces et leur
origine, l’organisation de la biodiversité et l’identification des zones à enjeux de protection.
1.2 Les bases de données sur la diversité biologiques marines
La systématique et la taxonomie explorent la biodiversité en dénombrant et en classifiant par taxon les
êtres vivants (Dépraz et al., 2009) alors que l'un des principaux outils pour évaluer la diversité
biologique est de réaliser un inventaire du patrimoine naturel et de créer une base de données. Si
l’inventaire permet d’approfondir les connaissances sur la biodiversité afin d'en réaliser un suivi et
identifier si celle-ci est menacée, la base de données, quant à elle, permet, de structurer et organiser ces
connaissances et les rendre visibles et exploitables en temps utile. Au niveau international et régional,
il existe quelques bases de données, qui constituent des référentiels virtuels utilisés par les taxonomistes
et les spécialistes de la biodiversité marine. Parmi les bases de données consultées (tableau 1) :
Tableau 1 : Les bases de données les plus consultées
Nom de la base de données
Groupes taxonomiques couverts
Lien
WORMS
Tous
http://www.marinespecies.org/
DORIS
Mollusques et Crustacés
http://doris.ffessm.fr/
Yumpu
Mollusques
https://www.yumpu.com/en/mollusca
IDSCARO
Mollusques
http://www.idscaro.net/sci/01_coll/
Figure 1 : Illustration des bases de données WoRMS et IDSCARO
WORMS
IDSCARO
1 Généralités
1.1 Les inventaires de la diversité biologique marine
L’utilisation des inventaires de la biodiversité prend de plus en plus d’importance dans différents
domaines de la conservation et de la valorisation des ressources marine vivantes. L’élaboration et le
partage de ces inventaires sont devenus aujourd’hui incontournables pour la planification et l’utilisation
de l’espace marin et côtier et pour évaluer les effets des activités humaines et des facteurs naturels sur
l’évolution de la structure de la biodiversité marine. Ces inventaires permettent de suivre cette évolution
et toutes les modifications qui peuvent affecter la diversité des espèces, la complexité de la chaine
écologique : structure, raréfaction, disparition ou apparition de nouvelles espèces recherchées en priorité
lors de la mise à jour des inventaires de la biodiversité marine.
La notion d’inventaires a sensiblement évolué depuis les premiers inventaires naturalistes, sous forme
de listes d’espèces présentes sur un espace donné à un moment donné, généralement qualitatif
(présence), parfois quantitatif (effectifs, % de recouvrement), pour être appuyés de nos jours par les
études de la génomique et la biologie moléculaire. Les inventaires de la biodiversité sont réalisés pour
mieux comprendre la nature et protéger la biodiversité, à travers la distribution des espèces et leur
origine, l’organisation de la biodiversité et l’identification des zones à enjeux de protection.
1.2 Les bases de données sur la diversité biologiques marines
La systématique et la taxonomie explorent la biodiversité en dénombrant et en classifiant par taxon les
êtres vivants (Dépraz et al., 2009) alors que l'un des principaux outils pour évaluer la diversité
biologique est de réaliser un inventaire du patrimoine naturel et de créer une base de données. Si
l’inventaire permet d’approfondir les connaissances sur la biodiversité afin d'en réaliser un suivi et
identifier si celle-ci est menacée, la base de données, quant à elle, permet, de structurer et organiser ces
connaissances et les rendre visibles et exploitables en temps utile. Au niveau international et régional,
il existe quelques bases de données, qui constituent des référentiels virtuels utilisés par les taxonomistes
et les spécialistes de la biodiversité marine. Parmi les bases de données consultées (tableau 1) :
Tableau 1 : Les bases de données les plus consultées
Nom de la base de données
Groupes taxonomiques couverts
Lien
WORMS
Tous
http://www.marinespecies.org/
DORIS
Mollusques et Crustacés
http://doris.ffessm.fr/
Yumpu
Mollusques
https://www.yumpu.com/en/mollusca
IDSCARO
Mollusques
http://www.idscaro.net/sci/01_coll/
Figure 1 : Illustration des bases de données WoRMS et IDSCARO
WORMS
IDSCARO