Chapitre Premier : Généralités et Méthodes d’étude
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 Diversité taxonomique ∆ (WARWICK et CLARKE, 1995)
La diversité taxonomique peut-être définie comme une distance taxonomique entre deux
organismes choisis au hasard. Cette distance est quantifiée comme étant la distance établie par la
classification linnéenne ou phylogénétique (Clarke et WARWICK, 1998).
∆ correspond au nombre moyen de niveaux hiérarchiques dans la classification taxonomique qui
séparent deux individus tirés au hasard appartenant à la même espèce ou à des espèces
différentes. Autrement dit, il mesure l’éloignement taxonomique moyen entre deux individus de
même espèce ou d’espèces différentes dans un échantillon.
∆ se calcule à partir de la formule 18 :
∆= 2
∑ ∑ 𝜔𝜔 𝑙𝑙 𝑖𝑖 𝑥𝑥 𝑙𝑙 𝑥𝑥 𝑖𝑖
𝑙𝑙<𝑖𝑖
𝑁𝑁(𝑁𝑁−1)
Avec : xi (i = 1, ..., S) l’abondance de la ième espèce ;
N (= Σi xi) le nombre total d’individus dans l’échantillon ;
ωij la distance à parcourir entre l’espèce i et le premier nœud commun avec l’espèce j
dans la classification hiérarchique.
La double somme s’effectue sur toutes les paires d’espèces i et j.
Il est intéressant de noter que ∆ est une extension de l’indice de Simpson (1-D) et cela si on
considère 𝜔𝜔R ij = 1 (quand la hiérarchie taxonomique est en quelque sorte ignorée et que toutes les
espèces sont différentes mais du même genre). ∆ se réduit à l’indice de Simpson (1-D) et devrait
donc logiquement être sensible aux espèces dominantes.
 Distinction taxonomique ∆* (WARWICK et CLARKE, 1995)
Cette distance a été définie par Clarke et Warwick (1995) comme une distance moyenne entre
deux individus à condition qu’ils appartiennent à des espèces différentes. Cette distance est, par
conséquent, aperçu comme une mesure de parenté taxonomique pure.
∆* était proposé afin de limiter l’influence des espèces dominante, pour un échantillonnage
donné, cet indice correspond au nombre moyen de niveaux hiérarchiques dans la classification
taxonomique qui sépare deux individus tirés au hasard appartenant uniquement à des espèces
différentes.
∆* est calculé à partir de la formule 19 :
∆
∗
=
∑ ∑ ω ij x i x j
i ∑ ∑ x i x j
i Avec : xi (i = 1, ..., S) l’abondance de la ième espèce et
ωij la distance à parcourir entre l’espèce i et le premier nœud commun avec l’espèce j
dans la classification hiérarchique.
La double somme s’effectue sur toutes les paires d’espèces i et j.